32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_57070 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4962  hypothetical protein  93.69 
 
 
333 aa  634    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.391829  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57070  hypothetical protein  100 
 
 
333 aa  667    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0943  hypothetical protein  66.04 
 
 
330 aa  434  1e-121  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.367805 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4961  hypothetical protein  45.65 
 
 
333 aa  316  4e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.694286  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57060  hypothetical protein  45.35 
 
 
335 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1200  hypothetical protein  46.27 
 
 
335 aa  311  1e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.142665 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4367  hypothetical protein  46.69 
 
 
336 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.222302 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1357  hypothetical protein  46.69 
 
 
375 aa  305  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.138079  normal  0.215405 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0964  hypothetical protein  46.69 
 
 
336 aa  305  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.198535  normal  0.689775 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4492  hypothetical protein  46.73 
 
 
336 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0946277  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4076  hypothetical protein  42.39 
 
 
335 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4381  hypothetical protein  42.09 
 
 
335 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0944  hypothetical protein  45.11 
 
 
337 aa  278  1e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.659342  normal  0.734525 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1846  protein of unknown function DUF481  36.89 
 
 
351 aa  230  2e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1764  hypothetical protein  35.07 
 
 
351 aa  228  1e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2570  hypothetical protein  34.02 
 
 
346 aa  222  7e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2264  hypothetical protein  33.93 
 
 
346 aa  222  7e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0693815  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0113  hypothetical protein  30.45 
 
 
331 aa  129  9.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0109  hypothetical protein  27.1 
 
 
329 aa  125  1e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0117  hypothetical protein  30.15 
 
 
331 aa  125  1e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0114  hypothetical protein  26.81 
 
 
329 aa  124  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0687801 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0118  hypothetical protein  28.83 
 
 
331 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0113  hypothetical protein  24.53 
 
 
318 aa  104  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0881  alanine racemase region  25 
 
 
356 aa  89  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.140785  hitchhiker  0.000185996 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0527  hypothetical protein  20.85 
 
 
346 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1182  hypothetical protein  26.46 
 
 
382 aa  67  0.0000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.155999 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2347  hypothetical protein  27.7 
 
 
333 aa  64.3  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000241931  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0708  hypothetical protein  23.53 
 
 
239 aa  50.1  0.00005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0114  hypothetical protein  47.5 
 
 
177 aa  47.8  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.806445 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0842  hypothetical protein  23.08 
 
 
347 aa  47.4  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.583593 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3075  hypothetical protein  31.17 
 
 
347 aa  45.8  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.153662  normal  0.0283688 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3691  hypothetical protein  20.87 
 
 
363 aa  44.3  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>