26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_0118 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_0117  hypothetical protein  98.49 
 
 
331 aa  679    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0118  hypothetical protein  100 
 
 
331 aa  686    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0113  hypothetical protein  95.77 
 
 
331 aa  664    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0114  hypothetical protein  67.8 
 
 
329 aa  476  1e-133  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0687801 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0109  hypothetical protein  69.26 
 
 
329 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0113  hypothetical protein  65.51 
 
 
318 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0943  hypothetical protein  30.53 
 
 
330 aa  136  4e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.367805 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0114  hypothetical protein  52.63 
 
 
177 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.806445 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4962  hypothetical protein  29.71 
 
 
333 aa  125  9e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.391829  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57070  hypothetical protein  28.83 
 
 
333 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57060  hypothetical protein  25.74 
 
 
335 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4367  hypothetical protein  27.22 
 
 
336 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.222302 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4961  hypothetical protein  25.44 
 
 
333 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.694286  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4381  hypothetical protein  26.8 
 
 
335 aa  104  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0964  hypothetical protein  25.96 
 
 
336 aa  103  6e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.198535  normal  0.689775 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1357  hypothetical protein  26.63 
 
 
375 aa  102  9e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.138079  normal  0.215405 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1200  hypothetical protein  26.99 
 
 
335 aa  101  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.142665 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4492  hypothetical protein  25.69 
 
 
336 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0946277  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4076  hypothetical protein  25.86 
 
 
335 aa  100  5e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1764  hypothetical protein  25.29 
 
 
351 aa  97.4  3e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1846  protein of unknown function DUF481  25.14 
 
 
351 aa  97.1  4e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0944  hypothetical protein  23.44 
 
 
337 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.659342  normal  0.734525 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2264  hypothetical protein  24.85 
 
 
346 aa  86.3  8e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0693815  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2570  hypothetical protein  24.23 
 
 
346 aa  81.3  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0527  hypothetical protein  19.3 
 
 
346 aa  50.8  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0881  alanine racemase region  21.13 
 
 
356 aa  42.7  0.008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.140785  hitchhiker  0.000185996 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>