24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_0114 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_0114  hypothetical protein  100 
 
 		 177 aa  362  1e-99  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.806445 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0114  hypothetical protein  78.36 
 
 		 329 aa  214  7e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0687801 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0109  hypothetical protein  84.33 
 
 		 329 aa  201  4e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0113  hypothetical protein  65.04 
 
 		 318 aa  177  7e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0113  hypothetical protein  52.8 
 
 		 331 aa  140  7e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0117  hypothetical protein  52.8 
 
 		 331 aa  140  8e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0118  hypothetical protein  52.8 
 
 		 331 aa  140  8e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1846  protein of unknown function DUF481  46.15 
 
 		 351 aa  57.4  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1764  hypothetical protein  46.67 
 
 		 351 aa  55.8  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4381  hypothetical protein  31.31 
 
 		 335 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4962  hypothetical protein  46.94 
 
 		 333 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.391829  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57060  hypothetical protein  37.5 
 
 		 335 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4076  hypothetical protein  32.22 
 
 		 335 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1200  hypothetical protein  38.98 
 
 		 335 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142665 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4367  hypothetical protein  36.76 
 
 		 336 aa  52  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.222302 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4961  hypothetical protein  35.94 
 
 		 333 aa  51.6  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.694286  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2264  hypothetical protein  40.98 
 
 		 346 aa  51.2  0.000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0693815  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1357  hypothetical protein  36.76 
 
 		 375 aa  50.8  0.000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.138079  normal  0.215405 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57070  hypothetical protein  40.82 
 
 		 333 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2570  hypothetical protein  39.34 
 
 		 346 aa  50.1  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0964  hypothetical protein  33.82 
 
 		 336 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.198535  normal  0.689775 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0943  hypothetical protein  48.78 
 
 		 330 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.367805 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4492  hypothetical protein  34.69 
 
 		 336 aa  44.7  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0946277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0944  hypothetical protein  38.46 
 
 		 337 aa  42  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.659342  normal  0.734525 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>