31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_1764 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_1846  protein of unknown function DUF481  88.6 
 
 
351 aa  656    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1764  hypothetical protein  100 
 
 
351 aa  722    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2264  hypothetical protein  68.09 
 
 
346 aa  513  1e-144  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0693815  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2570  hypothetical protein  67.81 
 
 
346 aa  510  1e-143  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0944  hypothetical protein  43.64 
 
 
337 aa  308  9e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.659342  normal  0.734525 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57060  hypothetical protein  43.31 
 
 
335 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4961  hypothetical protein  43.31 
 
 
333 aa  305  6e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.694286  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4367  hypothetical protein  41.91 
 
 
336 aa  300  2e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.222302 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4492  hypothetical protein  43.56 
 
 
336 aa  298  7e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0946277  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1357  hypothetical protein  41.33 
 
 
375 aa  296  4e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.138079  normal  0.215405 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0964  hypothetical protein  41.5 
 
 
336 aa  296  4e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.198535  normal  0.689775 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1200  hypothetical protein  42.03 
 
 
335 aa  295  1e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.142665 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4076  hypothetical protein  38.79 
 
 
335 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4381  hypothetical protein  37.97 
 
 
335 aa  268  1e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57070  hypothetical protein  35.07 
 
 
333 aa  228  2e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4962  hypothetical protein  34.97 
 
 
333 aa  225  1e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.391829  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0943  hypothetical protein  31.72 
 
 
330 aa  191  2e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.367805 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0113  hypothetical protein  27.79 
 
 
331 aa  106  5e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0114  hypothetical protein  27.51 
 
 
329 aa  106  7e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0687801 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0109  hypothetical protein  27.84 
 
 
329 aa  103  6e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0117  hypothetical protein  25.86 
 
 
331 aa  98.2  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0118  hypothetical protein  25.29 
 
 
331 aa  97.4  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0113  hypothetical protein  27.46 
 
 
318 aa  94.7  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0527  hypothetical protein  21.57 
 
 
346 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0881  alanine racemase region  22.06 
 
 
356 aa  70.1  0.00000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.140785  hitchhiker  0.000185996 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2347  hypothetical protein  21.69 
 
 
333 aa  65.5  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000241931  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1182  hypothetical protein  24.56 
 
 
382 aa  58.2  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.155999 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0114  hypothetical protein  50 
 
 
177 aa  53.1  0.000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.806445 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1484  hypothetical protein  22.73 
 
 
377 aa  44.3  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3691  hypothetical protein  37.88 
 
 
363 aa  43.9  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0403  hypothetical protein  21.38 
 
 
376 aa  42.7  0.008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>