31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_4492 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1357  hypothetical protein  95.54 
 
 		 375 aa  662    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.138079  normal  0.215405 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0964  hypothetical protein  92.86 
 
 		 336 aa  655    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.198535  normal  0.689775 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4492  hypothetical protein  100 
 
 		 336 aa  689    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0946277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4367  hypothetical protein  98.21 
 
 		 336 aa  680    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.222302 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1200  hypothetical protein  78.57 
 
 		 335 aa  564  1e-160  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142665 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4381  hypothetical protein  70.54 
 
 		 335 aa  518  1e-146  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4076  hypothetical protein  70.24 
 
 		 335 aa  513  1e-144  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0944  hypothetical protein  72.56 
 
 		 337 aa  491  9.999999999999999e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.659342  normal  0.734525 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4961  hypothetical protein  61.31 
 
 		 333 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.694286  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57060  hypothetical protein  61.31 
 
 		 335 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2570  hypothetical protein  45.56 
 
 		 346 aa  317  1e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2264  hypothetical protein  45.32 
 
 		 346 aa  316  3e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0693815  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57070  hypothetical protein  46.15 
 
 		 333 aa  308  8e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4962  hypothetical protein  45.83 
 
 		 333 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.391829  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1764  hypothetical protein  42.49 
 
 		 351 aa  304  2.0000000000000002e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1846  protein of unknown function DUF481  41.35 
 
 		 351 aa  293  3e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0943  hypothetical protein  44.38 
 
 		 330 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.367805 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0113  hypothetical protein  27.51 
 
 		 331 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0117  hypothetical protein  26.92 
 
 		 331 aa  110  5e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0118  hypothetical protein  26.92 
 
 		 331 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0114  hypothetical protein  24.48 
 
 		 329 aa  103  3e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0687801 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0109  hypothetical protein  24.84 
 
 		 329 aa  103  4e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0113  hypothetical protein  24.16 
 
 		 318 aa  102  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0527  hypothetical protein  23.59 
 
 		 346 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0881  alanine racemase region  21.66 
 
 		 356 aa  76.3  0.0000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.140785  hitchhiker  0.000185996 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1182  hypothetical protein  24.47 
 
 		 382 aa  75.1  0.000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.155999 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2347  hypothetical protein  24.44 
 
 		 333 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000241931  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3691  hypothetical protein  22.22 
 
 		 363 aa  55.8  0.0000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3075  hypothetical protein  22.52 
 
 		 347 aa  51.2  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.153662  normal  0.0283688 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0842  hypothetical protein  22.71 
 
 		 347 aa  48.1  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.583593 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0114  hypothetical protein  34.69 
 
 		 177 aa  45.1  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.806445 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>