19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3075 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3075  hypothetical protein  100 
 
 		 347 aa  711    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.153662  normal  0.0283688 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0842  hypothetical protein  69.63 
 
 		 347 aa  494  1e-139  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.583593 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0527  hypothetical protein  23.08 
 
 		 346 aa  57.4  0.0000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0943  hypothetical protein  23.39 
 
 		 330 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.367805 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2570  hypothetical protein  32.58 
 
 		 346 aa  48.9  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57060  hypothetical protein  26.53 
 
 		 335 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4367  hypothetical protein  21.85 
 
 		 336 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.222302 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0964  hypothetical protein  35.21 
 
 		 336 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.198535  normal  0.689775 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1357  hypothetical protein  21.33 
 
 		 375 aa  47  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.138079  normal  0.215405 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2264  hypothetical protein  32.58 
 
 		 346 aa  47  0.0005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0693815  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4381  hypothetical protein  24.67 
 
 		 335 aa  46.2  0.0009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4961  hypothetical protein  25.51 
 
 		 333 aa  45.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.694286  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57070  hypothetical protein  31.17 
 
 		 333 aa  45.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4962  hypothetical protein  31.17 
 
 		 333 aa  45.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.391829  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0114  hypothetical protein  23.08 
 
 		 329 aa  44.3  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0687801 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1681  protein of unknown function DUF481  26.21 
 
 		 419 aa  44.7  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4076  hypothetical protein  21.88 
 
 		 335 aa  43.9  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4492  hypothetical protein  22.03 
 
 		 336 aa  43.1  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0946277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1182  hypothetical protein  32.14 
 
 		 382 aa  42.7  0.009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.155999 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>