32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1182 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_1182  hypothetical protein  100 
 
 
382 aa  788    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.155999 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0527  hypothetical protein  25.08 
 
 
346 aa  105  1e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2347  hypothetical protein  25 
 
 
333 aa  82  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000241931  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0944  hypothetical protein  23.6 
 
 
337 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.659342  normal  0.734525 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1200  hypothetical protein  25.44 
 
 
335 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.142665 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4367  hypothetical protein  24.86 
 
 
336 aa  76.6  0.0000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.222302 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4492  hypothetical protein  24.38 
 
 
336 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0946277  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1357  hypothetical protein  23.68 
 
 
375 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.138079  normal  0.215405 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4962  hypothetical protein  26.82 
 
 
333 aa  70.1  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.391829  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0881  alanine racemase region  23.14 
 
 
356 aa  69.3  0.00000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.140785  hitchhiker  0.000185996 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0964  hypothetical protein  23.77 
 
 
336 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.198535  normal  0.689775 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57070  hypothetical protein  26.25 
 
 
333 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4076  hypothetical protein  22.32 
 
 
335 aa  66.2  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4381  hypothetical protein  21.96 
 
 
335 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57060  hypothetical protein  21.32 
 
 
335 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4961  hypothetical protein  21.62 
 
 
333 aa  63.5  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.694286  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0943  hypothetical protein  24.01 
 
 
330 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.367805 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0708  hypothetical protein  24.07 
 
 
239 aa  61.2  0.00000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1764  hypothetical protein  24.73 
 
 
351 aa  60.8  0.00000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1846  protein of unknown function DUF481  23.1 
 
 
351 aa  59.3  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0842  hypothetical protein  20.35 
 
 
347 aa  57.4  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.583593 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0117  hypothetical protein  26.63 
 
 
331 aa  51.6  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0113  hypothetical protein  26.04 
 
 
331 aa  50.4  0.00006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0118  hypothetical protein  26.04 
 
 
331 aa  49.7  0.00008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2264  hypothetical protein  23.77 
 
 
346 aa  47.8  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0693815  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2570  hypothetical protein  23.36 
 
 
346 aa  47.4  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3075  hypothetical protein  31.94 
 
 
347 aa  47  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.153662  normal  0.0283688 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0402  hypothetical protein  22.39 
 
 
372 aa  46.2  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0114  hypothetical protein  25.23 
 
 
329 aa  45.4  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0687801 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0046  putative salt-induced outer membrane protein-like  23.23 
 
 
268 aa  45.4  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.843258  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3691  hypothetical protein  23.55 
 
 
363 aa  44.3  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2791  hypothetical protein  27.85 
 
 
245 aa  43.5  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00000611146  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>