32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4962 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4962  hypothetical protein  100 
 
 		 333 aa  667    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.391829  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57070  hypothetical protein  93.69 
 
 		 333 aa  634    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0943  hypothetical protein  65.41 
 
 		 330 aa  436  1e-121  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.367805 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4961  hypothetical protein  46.25 
 
 		 333 aa  317  2e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.694286  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57060  hypothetical protein  45.95 
 
 		 335 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1200  hypothetical protein  46.15 
 
 		 335 aa  308  8e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142665 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4367  hypothetical protein  46.06 
 
 		 336 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.222302 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0964  hypothetical protein  46.36 
 
 		 336 aa  306  3e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.198535  normal  0.689775 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1357  hypothetical protein  46.06 
 
 		 375 aa  305  7e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.138079  normal  0.215405 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4492  hypothetical protein  46.39 
 
 		 336 aa  298  7e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0946277  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4381  hypothetical protein  42.99 
 
 		 335 aa  291  1e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4076  hypothetical protein  43.28 
 
 		 335 aa  290  2e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0944  hypothetical protein  45.43 
 
 		 337 aa  282  6.000000000000001e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.659342  normal  0.734525 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1846  protein of unknown function DUF481  36.21 
 
 		 351 aa  228  1e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1764  hypothetical protein  34.97 
 
 		 351 aa  225  9e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2570  hypothetical protein  32.95 
 
 		 346 aa  223  3e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2264  hypothetical protein  32.56 
 
 		 346 aa  222  7e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0693815  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0113  hypothetical protein  31.18 
 
 		 331 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0117  hypothetical protein  30.88 
 
 		 331 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0114  hypothetical protein  27.76 
 
 		 329 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0687801 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0109  hypothetical protein  27.1 
 
 		 329 aa  127  3e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0118  hypothetical protein  29.71 
 
 		 331 aa  125  9e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0113  hypothetical protein  24.46 
 
 		 318 aa  108  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0527  hypothetical protein  21.92 
 
 		 346 aa  83.2  0.000000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0881  alanine racemase region  24.49 
 
 		 356 aa  82.4  0.000000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.140785  hitchhiker  0.000185996 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1182  hypothetical protein  26.71 
 
 		 382 aa  67  0.0000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.155999 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2347  hypothetical protein  24.84 
 
 		 333 aa  64.3  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000241931  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0114  hypothetical protein  47.5 
 
 		 177 aa  47.8  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.806445 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3691  hypothetical protein  28.3 
 
 		 363 aa  44.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0842  hypothetical protein  34.72 
 
 		 347 aa  45.1  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.583593 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3075  hypothetical protein  31.17 
 
 		 347 aa  45.1  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.153662  normal  0.0283688 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0708  hypothetical protein  23.04 
 
 		 239 aa  44.3  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>