12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0402 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0402  hypothetical protein  100 
 
 		 372 aa  752    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0403  hypothetical protein  45.88 
 
 		 376 aa  325  9e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1484  hypothetical protein  39.83 
 
 		 377 aa  252  7e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1695  hypothetical protein  35.86 
 
 		 372 aa  236  6e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0466437  normal  0.4306 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2899  hypothetical protein  37.5 
 
 		 333 aa  236  7e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0123115  hitchhiker  0.000697363 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0881  alanine racemase region  23.61 
 
 		 356 aa  55.5  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.140785  hitchhiker  0.000185996 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3691  hypothetical protein  23.91 
 
 		 363 aa  50.8  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1733  hypothetical protein  22.61 
 
 		 317 aa  48.9  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0231419  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0708  hypothetical protein  26.89 
 
 		 239 aa  48.1  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1182  hypothetical protein  22.39 
 
 		 382 aa  46.2  0.0008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.155999 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2791  hypothetical protein  27.14 
 
 		 245 aa  46.2  0.0009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00000611146  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2347  hypothetical protein  22.22 
 
 		 333 aa  45.8  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000241931  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>