32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2264 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_2570  hypothetical protein  96.53 
 
 		 346 aa  692    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2264  hypothetical protein  100 
 
 		 346 aa  711    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0693815  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1846  protein of unknown function DUF481  70.09 
 
 		 351 aa  524  1e-148  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1764  hypothetical protein  68.09 
 
 		 351 aa  513  1e-144  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0944  hypothetical protein  46.75 
 
 		 337 aa  323  2e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.659342  normal  0.734525 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4367  hypothetical protein  45.86 
 
 		 336 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.222302 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1357  hypothetical protein  45.56 
 
 		 375 aa  319  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.138079  normal  0.215405 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1200  hypothetical protein  45.88 
 
 		 335 aa  317  2e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142665 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0964  hypothetical protein  44.74 
 
 		 336 aa  316  3e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.198535  normal  0.689775 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4492  hypothetical protein  46.58 
 
 		 336 aa  311  1e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0946277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57060  hypothetical protein  43.24 
 
 		 335 aa  310  2e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4961  hypothetical protein  43.24 
 
 		 333 aa  310  2e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.694286  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4076  hypothetical protein  42.94 
 
 		 335 aa  291  8e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4381  hypothetical protein  42.65 
 
 		 335 aa  290  2e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57070  hypothetical protein  33.93 
 
 		 333 aa  222  8e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4962  hypothetical protein  32.56 
 
 		 333 aa  222  8e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.391829  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0943  hypothetical protein  32.71 
 
 		 330 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.367805 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0114  hypothetical protein  28 
 
 		 329 aa  105  9e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0687801 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0113  hypothetical protein  25.98 
 
 		 318 aa  99.4  8e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0109  hypothetical protein  27.33 
 
 		 329 aa  97.1  4e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0113  hypothetical protein  25.37 
 
 		 331 aa  90.9  3e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0117  hypothetical protein  26.16 
 
 		 331 aa  88.2  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0118  hypothetical protein  24.85 
 
 		 331 aa  86.3  8e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0527  hypothetical protein  24.92 
 
 		 346 aa  77.4  0.0000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2347  hypothetical protein  23.85 
 
 		 333 aa  69.3  0.00000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000241931  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0881  alanine racemase region  21.78 
 
 		 356 aa  68.6  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.140785  hitchhiker  0.000185996 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3691  hypothetical protein  23.55 
 
 		 363 aa  55.8  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0403  hypothetical protein  22.57 
 
 		 376 aa  53.5  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0114  hypothetical protein  45.65 
 
 		 177 aa  48.5  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.806445 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3075  hypothetical protein  32.58 
 
 		 347 aa  47  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.153662  normal  0.0283688 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1182  hypothetical protein  23.83 
 
 		 382 aa  45.8  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.155999 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0708  hypothetical protein  22.46 
 
 		 239 aa  43.5  0.006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>