20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0708 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_0708  hypothetical protein  100 
 
 		 239 aa  484  1e-136  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0527  hypothetical protein  33.18 
 
 		 346 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2347  hypothetical protein  32.38 
 
 		 333 aa  90.9  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000241931  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0881  alanine racemase region  31.41 
 
 		 356 aa  88.2  9e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.140785  hitchhiker  0.000185996 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1182  hypothetical protein  24.07 
 
 		 382 aa  61.2  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.155999 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1484  hypothetical protein  22.57 
 
 		 377 aa  56.6  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2899  hypothetical protein  23.77 
 
 		 333 aa  55.5  0.0000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0123115  hitchhiker  0.000697363 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2791  hypothetical protein  28.97 
 
 		 245 aa  54.7  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00000611146  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0403  hypothetical protein  27.08 
 
 		 376 aa  53.1  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0606  hypothetical protein  25.1 
 
 		 250 aa  52  0.000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0046  putative salt-induced outer membrane protein-like  21.43 
 
 		 268 aa  50.4  0.00003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.843258  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57070  hypothetical protein  23.53 
 
 		 333 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0402  hypothetical protein  26.89 
 
 		 372 aa  48.1  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1200  hypothetical protein  23.92 
 
 		 335 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142665 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1695  hypothetical protein  25.86 
 
 		 372 aa  47  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0466437  normal  0.4306 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4962  hypothetical protein  23.04 
 
 		 333 aa  44.3  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.391829  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2264  hypothetical protein  22.46 
 
 		 346 aa  43.5  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0693815  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4492  hypothetical protein  26.53 
 
 		 336 aa  42  0.009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0946277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2570  hypothetical protein  21.93 
 
 		 346 aa  42  0.009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0944  hypothetical protein  21.57 
 
 		 337 aa  41.6  0.01  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.659342  normal  0.734525 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>