27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_0117 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_0117  hypothetical protein  100 
 
 
331 aa  686    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0118  hypothetical protein  98.49 
 
 
331 aa  679    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0113  hypothetical protein  96.68 
 
 
331 aa  667    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0114  hypothetical protein  67.8 
 
 
329 aa  476  1e-133  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0687801 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0109  hypothetical protein  68.61 
 
 
329 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0113  hypothetical protein  64.87 
 
 
318 aa  448  1e-125  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0943  hypothetical protein  29.91 
 
 
330 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.367805 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0114  hypothetical protein  52.63 
 
 
177 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.806445 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4962  hypothetical protein  30.88 
 
 
333 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.391829  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57070  hypothetical protein  30.15 
 
 
333 aa  125  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57060  hypothetical protein  26.44 
 
 
335 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4367  hypothetical protein  27.22 
 
 
336 aa  109  5e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.222302 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4961  hypothetical protein  25.44 
 
 
333 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.694286  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4381  hypothetical protein  27.38 
 
 
335 aa  108  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0964  hypothetical protein  25.96 
 
 
336 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.198535  normal  0.689775 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1357  hypothetical protein  26.63 
 
 
375 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.138079  normal  0.215405 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4076  hypothetical protein  26.44 
 
 
335 aa  103  6e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1200  hypothetical protein  26.99 
 
 
335 aa  102  8e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.142665 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4492  hypothetical protein  25.69 
 
 
336 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0946277  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1846  protein of unknown function DUF481  25.43 
 
 
351 aa  98.6  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1764  hypothetical protein  25.86 
 
 
351 aa  98.2  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0944  hypothetical protein  23.44 
 
 
337 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.659342  normal  0.734525 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2264  hypothetical protein  26.16 
 
 
346 aa  88.2  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0693815  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2570  hypothetical protein  24.54 
 
 
346 aa  82.4  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0527  hypothetical protein  19.3 
 
 
346 aa  50.4  0.00004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1182  hypothetical protein  25.48 
 
 
382 aa  43.9  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.155999 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0842  hypothetical protein  23.11 
 
 
347 aa  42.4  0.01  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.583593 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>