32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0943 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_0943  hypothetical protein  100 
 
 		 330 aa  657    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.367805 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4962  hypothetical protein  64.35 
 
 		 333 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.391829  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57070  hypothetical protein  64.35 
 
 		 333 aa  444  1e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0964  hypothetical protein  45.65 
 
 		 336 aa  293  3e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.198535  normal  0.689775 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1200  hypothetical protein  44.28 
 
 		 335 aa  292  4e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142665 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4367  hypothetical protein  43.5 
 
 		 336 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.222302 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4492  hypothetical protein  44.51 
 
 		 336 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0946277  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1357  hypothetical protein  42.6 
 
 		 375 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.138079  normal  0.215405 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4961  hypothetical protein  41.52 
 
 		 333 aa  276  4e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.694286  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57060  hypothetical protein  41.52 
 
 		 335 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4381  hypothetical protein  41.27 
 
 		 335 aa  273  3e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4076  hypothetical protein  41.87 
 
 		 335 aa  271  1e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0944  hypothetical protein  44.16 
 
 		 337 aa  265  7e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.659342  normal  0.734525 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2570  hypothetical protein  32.04 
 
 		 346 aa  204  1e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2264  hypothetical protein  32.04 
 
 		 346 aa  203  3e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0693815  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1846  protein of unknown function DUF481  32.65 
 
 		 351 aa  196  5.000000000000001e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1764  hypothetical protein  31.47 
 
 		 351 aa  193  4e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0109  hypothetical protein  29.72 
 
 		 329 aa  147  3e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0114  hypothetical protein  28.79 
 
 		 329 aa  147  3e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0687801 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0113  hypothetical protein  30.24 
 
 		 331 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0118  hypothetical protein  30.54 
 
 		 331 aa  140  3e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0117  hypothetical protein  29.94 
 
 		 331 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0113  hypothetical protein  25.67 
 
 		 318 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0881  alanine racemase region  22.07 
 
 		 356 aa  72.8  0.000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.140785  hitchhiker  0.000185996 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0527  hypothetical protein  22.22 
 
 		 346 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2347  hypothetical protein  24.58 
 
 		 333 aa  63.5  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000241931  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1182  hypothetical protein  24.1 
 
 		 382 aa  62  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.155999 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3075  hypothetical protein  24.35 
 
 		 347 aa  57.4  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.153662  normal  0.0283688 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0842  hypothetical protein  22.37 
 
 		 347 aa  50.8  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.583593 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3691  hypothetical protein  21.27 
 
 		 363 aa  50.1  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0114  hypothetical protein  48.78 
 
 		 177 aa  48.9  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.806445 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0403  hypothetical protein  21.63 
 
 		 376 aa  44.3  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>