35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0881 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0881  alanine racemase region  100 
 
 		 356 aa  738    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.140785  hitchhiker  0.000185996 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0944  hypothetical protein  24.62 
 
 		 337 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.659342  normal  0.734525 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0527  hypothetical protein  22.38 
 
 		 346 aa  91.3  3e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57070  hypothetical protein  25 
 
 		 333 aa  89  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0708  hypothetical protein  31.41 
 
 		 239 aa  88.2  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1357  hypothetical protein  22.09 
 
 		 375 aa  82.8  0.000000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.138079  normal  0.215405 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4962  hypothetical protein  24.49 
 
 		 333 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.391829  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4961  hypothetical protein  22.32 
 
 		 333 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.694286  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57060  hypothetical protein  22.32 
 
 		 335 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0964  hypothetical protein  23.57 
 
 		 336 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.198535  normal  0.689775 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1200  hypothetical protein  23.92 
 
 		 335 aa  80.1  0.00000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142665 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4076  hypothetical protein  22.09 
 
 		 335 aa  80.1  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4367  hypothetical protein  21.66 
 
 		 336 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.222302 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4381  hypothetical protein  21.22 
 
 		 335 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4492  hypothetical protein  21.69 
 
 		 336 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0946277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0943  hypothetical protein  22.09 
 
 		 330 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.367805 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1764  hypothetical protein  22.06 
 
 		 351 aa  70.1  0.00000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1846  protein of unknown function DUF481  21.65 
 
 		 351 aa  69.7  0.00000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2347  hypothetical protein  22.32 
 
 		 333 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000241931  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2570  hypothetical protein  21.78 
 
 		 346 aa  68.9  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2264  hypothetical protein  21.78 
 
 		 346 aa  68.6  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0693815  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1182  hypothetical protein  23.69 
 
 		 382 aa  67  0.0000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.155999 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2899  hypothetical protein  23.31 
 
 		 333 aa  56.2  0.0000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0123115  hitchhiker  0.000697363 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0114  hypothetical protein  22.89 
 
 		 329 aa  55.5  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0687801 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0402  hypothetical protein  23.61 
 
 		 372 aa  55.5  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0109  hypothetical protein  21.5 
 
 		 329 aa  54.3  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0403  hypothetical protein  22.44 
 
 		 376 aa  52.8  0.000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3404  hypothetical protein  24.54 
 
 		 263 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0113  hypothetical protein  21.6 
 
 		 318 aa  51.6  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1695  hypothetical protein  21.53 
 
 		 372 aa  50.4  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0466437  normal  0.4306 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1484  hypothetical protein  20.46 
 
 		 377 aa  48.9  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3551  protein of unknown function DUF481  22.69 
 
 		 262 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1079  protein of unknown function DUF481  23.29 
 
 		 249 aa  47.4  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3487  hypothetical protein  22.69 
 
 		 262 aa  46.6  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0118  hypothetical protein  21.13 
 
 		 331 aa  42.7  0.009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>