27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_0113 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_0117  hypothetical protein  96.68 
 
 
331 aa  667    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0118  hypothetical protein  95.77 
 
 
331 aa  664    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0113  hypothetical protein  100 
 
 
331 aa  689    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0114  hypothetical protein  67.18 
 
 
329 aa  474  1e-133  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0687801 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0109  hypothetical protein  67.96 
 
 
329 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0113  hypothetical protein  64.24 
 
 
318 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0943  hypothetical protein  30.22 
 
 
330 aa  138  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.367805 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4962  hypothetical protein  31.18 
 
 
333 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.391829  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0114  hypothetical protein  52.63 
 
 
177 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.806445 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57070  hypothetical protein  30.45 
 
 
333 aa  129  9.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4367  hypothetical protein  27.6 
 
 
336 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.222302 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57060  hypothetical protein  25.81 
 
 
335 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4961  hypothetical protein  25.81 
 
 
333 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.694286  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4381  hypothetical protein  26.8 
 
 
335 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0964  hypothetical protein  26.33 
 
 
336 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.198535  normal  0.689775 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4076  hypothetical protein  27.01 
 
 
335 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1357  hypothetical protein  27 
 
 
375 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.138079  normal  0.215405 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4492  hypothetical protein  26.3 
 
 
336 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0946277  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1764  hypothetical protein  27.79 
 
 
351 aa  106  5e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1200  hypothetical protein  26.82 
 
 
335 aa  105  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.142665 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1846  protein of unknown function DUF481  27.01 
 
 
351 aa  104  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0944  hypothetical protein  24.3 
 
 
337 aa  100  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.659342  normal  0.734525 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2264  hypothetical protein  25.37 
 
 
346 aa  90.9  3e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0693815  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2570  hypothetical protein  24.77 
 
 
346 aa  86.3  7e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0527  hypothetical protein  21.02 
 
 
346 aa  52.8  0.000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0842  hypothetical protein  23.56 
 
 
347 aa  44.3  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.583593 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1182  hypothetical protein  24.84 
 
 
382 aa  42.4  0.01  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.155999 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>