22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0842 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0842  hypothetical protein  100 
 
 		 347 aa  705    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.583593 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3075  hypothetical protein  69.63 
 
 		 347 aa  494  1e-139  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.153662  normal  0.0283688 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0527  hypothetical protein  21.55 
 
 		 346 aa  69.7  0.00000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1182  hypothetical protein  19.2 
 
 		 382 aa  54.3  0.000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.155999 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57060  hypothetical protein  37.84 
 
 		 335 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4961  hypothetical protein  37.5 
 
 		 333 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.694286  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2347  hypothetical protein  23.87 
 
 		 333 aa  50.1  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000241931  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4381  hypothetical protein  22.97 
 
 		 335 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1681  protein of unknown function DUF481  27.03 
 
 		 419 aa  48.5  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4076  hypothetical protein  24.22 
 
 		 335 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0943  hypothetical protein  22.43 
 
 		 330 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.367805 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57070  hypothetical protein  23.08 
 
 		 333 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1200  hypothetical protein  23.11 
 
 		 335 aa  46.2  0.0009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142665 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4367  hypothetical protein  22.22 
 
 		 336 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.222302 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0370  hypothetical protein  25.11 
 
 		 332 aa  44.7  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.397767 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4962  hypothetical protein  34.72 
 
 		 333 aa  45.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.391829  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1357  hypothetical protein  27.1 
 
 		 375 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.138079  normal  0.215405 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0113  hypothetical protein  23.56 
 
 		 331 aa  44.3  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3691  hypothetical protein  22.4 
 
 		 363 aa  44.3  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0944  hypothetical protein  22.38 
 
 		 337 aa  43.9  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.659342  normal  0.734525 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4492  hypothetical protein  22.6 
 
 		 336 aa  43.9  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0946277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0964  hypothetical protein  22.71 
 
 		 336 aa  43.1  0.008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.198535  normal  0.689775 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>