78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0370 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0370  hypothetical protein  100 
 
 		 332 aa  662    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.397767 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3855  hypothetical protein  36.65 
 
 		 305 aa  177  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.248641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1733  hypothetical protein  34.58 
 
 		 317 aa  159  8e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0231419  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2051  hypothetical protein  28.88 
 
 		 248 aa  103  6e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000194447  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1079  protein of unknown function DUF481  27.83 
 
 		 249 aa  102  1e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0606  hypothetical protein  31.19 
 
 		 250 aa  101  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2309  protein of unknown function DUF481  29.44 
 
 		 244 aa  100  3e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.070466 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2791  hypothetical protein  29.44 
 
 		 245 aa  99  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00000611146  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0652  hypothetical protein  26.51 
 
 		 246 aa  91.3  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000000354938  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0792  hypothetical protein  26.46 
 
 		 246 aa  91.7  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.954407  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3655  hypothetical protein  25.91 
 
 		 245 aa  88.6  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03209  putative orphan protein  26.36 
 
 		 248 aa  88.6  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000209719  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1585  hypothetical protein  29.11 
 
 		 242 aa  87.8  2e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000281784  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3536  hypothetical protein  25.91 
 
 		 245 aa  88.2  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0831  hypothetical protein  25.91 
 
 		 245 aa  87  4e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.221265  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3461  protein of unknown function DUF481  25.91 
 
 		 245 aa  87  4e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3349  hypothetical protein  24.66 
 
 		 245 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000236372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0777  hypothetical protein  24.66 
 
 		 245 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0484485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3246  hypothetical protein  24.66 
 
 		 245 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0192004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0876  hypothetical protein  23.64 
 
 		 245 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0538553  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1087  hypothetical protein  25.12 
 
 		 246 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000312385  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0934  hypothetical protein  23.74 
 
 		 245 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3011  hypothetical protein  27.39 
 
 		 243 aa  75.9  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.809018  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2754  hypothetical protein  23.18 
 
 		 247 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.716555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3358  hypothetical protein  23.98 
 
 		 245 aa  68.9  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000013403  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3223  hypothetical protein  27.15 
 
 		 255 aa  67  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3360  hypothetical protein  27.15 
 
 		 255 aa  67  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.853104  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1844  putative outer membrane protein  26.29 
 
 		 241 aa  66.6  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000476612  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1424  putative outer membrane protein  26.29 
 
 		 241 aa  66.2  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.284815  decreased coverage  0.000282683 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1441  hypothetical protein  26.29 
 
 		 241 aa  66.2  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0990956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1456  hypothetical protein  26.29 
 
 		 241 aa  66.2  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.273825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1722  hypothetical protein  24.76 
 
 		 289 aa  64.7  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.281842  normal  0.346331 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03211  putative salt-induced outer membrane protein  23.08 
 
 		 267 aa  63.9  0.000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000342266  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2017  putative outer membrane protein  25.82 
 
 		 241 aa  63.2  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.277986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0878  hypothetical protein  23.64 
 
 		 246 aa  63.2  0.000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000368102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0880  hypothetical protein  24.43 
 
 		 246 aa  62.8  0.000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1469  hypothetical protein  24.29 
 
 		 252 aa  62.8  0.000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0334595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1910  hypothetical protein  24.29 
 
 		 252 aa  62.8  0.000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.155146  normal  0.390099 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1967  hypothetical protein  24.29 
 
 		 252 aa  62.8  0.000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1920  protein of unknown function DUF481  24.29 
 
 		 252 aa  63.2  0.000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.302148  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2440  hypothetical protein  24.29 
 
 		 252 aa  62.8  0.000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.350144  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01679  hypothetical protein  24.29 
 
 		 252 aa  63.2  0.000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1941  hypothetical protein  24.29 
 
 		 252 aa  62.8  0.000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00616425  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1803  hypothetical protein  24.29 
 
 		 252 aa  62.8  0.000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000450339  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01691  hypothetical protein  24.29 
 
 		 252 aa  63.2  0.000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2410  hypothetical protein  25.1 
 
 		 290 aa  62.4  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.756599 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0753  Salt-stress induced outer membrane protein  25.1 
 
 		 290 aa  61.2  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0424  hypothetical protein  24.7 
 
 		 290 aa  60.8  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.907602  normal  0.0687278 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0756  hypothetical protein  22.58 
 
 		 246 aa  59.7  0.00000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.189796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1569  hypothetical protein  21.82 
 
 		 251 aa  56.2  0.0000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000191147 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0878  hypothetical protein  24.69 
 
 		 254 aa  55.8  0.0000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.428575  normal  0.136015 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3357  putative salt-induced outer membrane protein  22.51 
 
 		 268 aa  55.5  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000088366  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0668  putative salt-induced outer membrane protein  24.86 
 
 		 259 aa  55.8  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000204125  hitchhiker  0.000000158177 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1233  hypothetical protein  23.4 
 
 		 268 aa  50.8  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0710  hypothetical protein  21.97 
 
 		 247 aa  50.1  0.00005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.410698  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1110  hypothetical protein  22.47 
 
 		 249 aa  50.1  0.00005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0752  hypothetical protein  21.72 
 
 		 247 aa  49.7  0.00007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00298481  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4213  hypothetical protein  24.89 
 
 		 249 aa  49.7  0.00008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.195016  hitchhiker  0.000349999 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0731  protein of unknown function DUF481  21.52 
 
 		 247 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000132441  hitchhiker  0.0000000113905 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0756  hypothetical protein  21.92 
 
 		 249 aa  49.3  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.216313  hitchhiker  0.00000194898 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2781  hypothetical protein  20.7 
 
 		 269 aa  48.9  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000100538  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0740  hypothetical protein  21.52 
 
 		 247 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000500329  hitchhiker  0.000136578 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3644  hypothetical protein  21.52 
 
 		 247 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000124667  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0686  hypothetical protein  21.52 
 
 		 251 aa  47.4  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000157748  hitchhiker  0.000330115 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3261  hypothetical protein  21.08 
 
 		 251 aa  47  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000014751  hitchhiker  0.0000121737 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0700  hypothetical protein  19.63 
 
 		 251 aa  46.6  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000147849  hitchhiker  0.000148247 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04136  hypothetical protein  21.83 
 
 		 256 aa  46.6  0.0006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.580295  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2347  hypothetical protein  23.98 
 
 		 333 aa  45.8  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000241931  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0842  hypothetical protein  25.11 
 
 		 347 aa  44.3  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.583593 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3587  hypothetical protein  25.44 
 
 		 247 aa  44.3  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.204251  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2903  hypothetical protein  24.6 
 
 		 229 aa  44.3  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00154459  normal  0.305825 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3065  putative salt-induced outer membrane protein  23.04 
 
 		 248 aa  43.9  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124339  normal  0.234711 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1484  hypothetical protein  22.95 
 
 		 377 aa  43.5  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0514  hypothetical protein  25.42 
 
 		 251 aa  43.1  0.006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0608195  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3551  protein of unknown function DUF481  24.05 
 
 		 262 aa  43.1  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3877  hypothetical protein  20.42 
 
 		 294 aa  42.7  0.008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1551  hypothetical protein  23.81 
 
 		 306 aa  42.7  0.008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0225106 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3487  hypothetical protein  24.05 
 
 		 262 aa  42.7  0.009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>