23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3691 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_3691  hypothetical protein  100 
 
 
363 aa  747    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4076  hypothetical protein  24.7 
 
 
335 aa  72.8  0.000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4381  hypothetical protein  22.53 
 
 
335 aa  63.2  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0403  hypothetical protein  22.63 
 
 
376 aa  58.2  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4367  hypothetical protein  22.22 
 
 
336 aa  56.6  0.0000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.222302 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2264  hypothetical protein  23.55 
 
 
346 aa  55.8  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0693815  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1357  hypothetical protein  21.4 
 
 
375 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.138079  normal  0.215405 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0964  hypothetical protein  23.05 
 
 
336 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.198535  normal  0.689775 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1200  hypothetical protein  21.9 
 
 
335 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.142665 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0402  hypothetical protein  23.91 
 
 
372 aa  50.8  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4492  hypothetical protein  21.4 
 
 
336 aa  49.7  0.00009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0946277  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4961  hypothetical protein  19.51 
 
 
333 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.694286  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57060  hypothetical protein  20.08 
 
 
335 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2570  hypothetical protein  22.78 
 
 
346 aa  48.9  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0943  hypothetical protein  20.72 
 
 
330 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.367805 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1952  hypothetical protein  23.45 
 
 
348 aa  47.8  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.440982  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0527  hypothetical protein  32.76 
 
 
346 aa  46.2  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57070  hypothetical protein  20.87 
 
 
333 aa  44.3  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4962  hypothetical protein  28.3 
 
 
333 aa  44.7  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.391829  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0842  hypothetical protein  22.4 
 
 
347 aa  44.3  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.583593 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1764  hypothetical protein  37.88 
 
 
351 aa  43.9  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1846  protein of unknown function DUF481  23.62 
 
 
351 aa  43.9  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0266  hypothetical protein  21.48 
 
 
277 aa  43.1  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.217773  normal  0.105001 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>