18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0403 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0403  hypothetical protein  100 
 
 		 376 aa  774    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0402  hypothetical protein  45.88 
 
 		 372 aa  325  9e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2899  hypothetical protein  35.33 
 
 		 333 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0123115  hitchhiker  0.000697363 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1484  hypothetical protein  34.17 
 
 		 377 aa  208  1e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1695  hypothetical protein  36.53 
 
 		 372 aa  203  4e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0466437  normal  0.4306 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2347  hypothetical protein  25.44 
 
 		 333 aa  60.1  0.00000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000241931  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3691  hypothetical protein  22.63 
 
 		 363 aa  58.2  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2264  hypothetical protein  22.57 
 
 		 346 aa  53.5  0.000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0693815  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0527  hypothetical protein  21.29 
 
 		 346 aa  53.1  0.000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0944  hypothetical protein  24.15 
 
 		 337 aa  53.1  0.000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.659342  normal  0.734525 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0708  hypothetical protein  27.08 
 
 		 239 aa  53.1  0.000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0881  alanine racemase region  22.44 
 
 		 356 aa  52.8  0.000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.140785  hitchhiker  0.000185996 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2570  hypothetical protein  22.22 
 
 		 346 aa  49.7  0.00009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0943  hypothetical protein  21.63 
 
 		 330 aa  44.7  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.367805 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57060  hypothetical protein  22.97 
 
 		 335 aa  44.3  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1200  hypothetical protein  23.43 
 
 		 335 aa  44.3  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142665 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4961  hypothetical protein  22.3 
 
 		 333 aa  43.1  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.694286  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1764  hypothetical protein  21.38 
 
 		 351 aa  42.7  0.009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>