50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1677 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1677  phosphate uptake regulator, PhoU  100 
 
 		 243 aa  498  1e-140  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0167747  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1615  phosphate uptake regulator, PhoU  80.66 
 
 		 243 aa  408  1e-113  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.587621  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1043  phosphate uptake regulator, PhoU  80.25 
 
 		 243 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000148702  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1240  transcriptional regulator, putative  79.84 
 
 		 243 aa  399  9.999999999999999e-111  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.448444  normal  0.338031 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0973  transcriptional regulator, putative  76.76 
 
 		 243 aa  389  1e-107  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1238  phosphate uptake regulator, PhoU  68.78 
 
 		 251 aa  311  3.9999999999999997e-84  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0205293  normal  0.236191 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0948  phosphate uptake regulator, PhoU  68.33 
 
 		 247 aa  306  2.0000000000000002e-82  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.478701 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1042  phosphate uptake regulator, PhoU  24.88 
 
 		 228 aa  64.3  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000260045  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0974  hypothetical protein  24.88 
 
 		 228 aa  63.5  0.000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1678  phosphate uptake regulator, PhoU  26.19 
 
 		 219 aa  60.1  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00615654  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1616  phosphate uptake regulator, PhoU  25.87 
 
 		 228 aa  58.2  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.46313  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1241  hypothetical protein  24.07 
 
 		 228 aa  55.5  0.0000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.375245  normal  0.531566 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4578  phosphate uptake regulator, PhoU  24.56 
 
 		 226 aa  55.1  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.92814  normal  0.180696 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1671  phosphate uptake regulator, PhoU  24.43 
 
 		 217 aa  53.5  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000164191  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2864  phosphate uptake regulator, PhoU  24.14 
 
 		 228 aa  52.4  0.000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1237  phosphate uptake regulator, PhoU  25.25 
 
 		 228 aa  52  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.316585  normal  0.224996 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4118  phosphate uptake regulator, PhoU  22.61 
 
 		 233 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2105  phosphate uptake regulator, PhoU  26.92 
 
 		 221 aa  51.6  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2996  phosphate uptake regulator, PhoU  26.83 
 
 		 219 aa  50.4  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0380  phosphate uptake regulator, PhoU  24.38 
 
 		 232 aa  50.8  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0239485  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2904  phosphate uptake regulator, PhoU  24.32 
 
 		 218 aa  49.3  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.18358  normal  0.0218976 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2889  phosphate uptake regulator, PhoU  24.32 
 
 		 218 aa  49.3  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.114573 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0947  phosphate uptake regulator, PhoU  24.88 
 
 		 228 aa  49.3  0.00006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.710255 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1238  phosphate uptake regulator, PhoU  27.1 
 
 		 219 aa  48.5  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.17919  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4144  phosphate uptake regulator, PhoU  21.61 
 
 		 233 aa  48.5  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4002  phosphate uptake regulator, PhoU  22.17 
 
 		 233 aa  48.5  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.584217  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1415  phosphate uptake regulator, PhoU  20.79 
 
 		 218 aa  47.8  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000133646  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0422  phosphate uptake regulator, PhoU  21.11 
 
 		 231 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.980511 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0748  phosphate uptake regulator, PhoU  22.22 
 
 		 216 aa  47  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00678381  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3273  phosphate uptake regulator, PhoU  24.88 
 
 		 233 aa  45.4  0.0007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0870914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1080  phosphate uptake regulator, PhoU  22.6 
 
 		 219 aa  45.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0158991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0710  phosphate uptake regulator, PhoU  23.23 
 
 		 218 aa  45.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0659  negative regulator for pho regulon and putative enzyme in phosphate metabolism  23.41 
 
 		 215 aa  44.3  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_150  phosphate transport system regulatory protein  23 
 
 		 221 aa  44.3  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1514  phosphate uptake regulator, PhoU  23.74 
 
 		 223 aa  43.5  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.875491  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2562  phosphate uptake regulator, PhoU  23.74 
 
 		 223 aa  43.5  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000003122  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4348  phosphate transport system regulatory protein PhoU, putative  26.5 
 
 		 218 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1929  phosphate uptake regulator, PhoU  23.15 
 
 		 226 aa  43.1  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0982293  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0909  phosphate uptake regulator, PhoU  24.32 
 
 		 226 aa  43.1  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4401  putative phosphate transport system regulatory protein PhoU  26.24 
 
 		 228 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4170  phosphate transport system regulatory protein PhoU  25.37 
 
 		 218 aa  42.7  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4288  putative phosphate transport system regulatory protein PhoU  25.37 
 
 		 218 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0302949 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4492  phosphate transporter PhoU  25.37 
 
 		 218 aa  42.7  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4018  phosphate transport system regulatory protein  25.37 
 
 		 218 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4008  phosphate transport system regulatory protein PhoU  25.37 
 
 		 218 aa  42.7  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3442  phosphate uptake regulator, PhoU  25.62 
 
 		 225 aa  42.4  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2293  phosphate uptake regulator, PhoU  26.58 
 
 		 236 aa  42  0.009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.612527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0115  phosphate uptake regulator, PhoU  22.34 
 
 		 234 aa  42  0.009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0432  hypothetical protein  26.85 
 
 		 223 aa  42  0.009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2870  phosphate uptake regulator, PhoU  23.36 
 
 		 220 aa  42  0.009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.905503  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>