37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1615 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1615  phosphate uptake regulator, PhoU  100 
 
 		 243 aa  498  1e-140  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.587621  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1043  phosphate uptake regulator, PhoU  80.25 
 
 		 243 aa  413  1e-114  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000148702  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1677  phosphate uptake regulator, PhoU  80.66 
 
 		 243 aa  408  1e-113  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0167747  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1240  transcriptional regulator, putative  80.25 
 
 		 243 aa  402  1e-111  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.448444  normal  0.338031 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0973  transcriptional regulator, putative  71.78 
 
 		 243 aa  360  1e-98  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1238  phosphate uptake regulator, PhoU  69.96 
 
 		 251 aa  331  7.000000000000001e-90  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0205293  normal  0.236191 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0948  phosphate uptake regulator, PhoU  68.83 
 
 		 247 aa  330  1e-89  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.478701 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1042  phosphate uptake regulator, PhoU  24.26 
 
 		 228 aa  59.3  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000260045  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1616  phosphate uptake regulator, PhoU  25.98 
 
 		 228 aa  57  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.46313  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4118  phosphate uptake regulator, PhoU  25.14 
 
 		 233 aa  55.5  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4578  phosphate uptake regulator, PhoU  22.35 
 
 		 226 aa  54.7  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.92814  normal  0.180696 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1678  phosphate uptake regulator, PhoU  26.7 
 
 		 219 aa  54.7  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00615654  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1241  hypothetical protein  24.02 
 
 		 228 aa  54.7  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.375245  normal  0.531566 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4002  phosphate uptake regulator, PhoU  25.14 
 
 		 233 aa  53.9  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.584217  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4144  phosphate uptake regulator, PhoU  24 
 
 		 233 aa  53.1  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0974  hypothetical protein  23.76 
 
 		 228 aa  52.8  0.000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1671  phosphate uptake regulator, PhoU  25.54 
 
 		 217 aa  52.4  0.000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000164191  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0422  phosphate uptake regulator, PhoU  23.81 
 
 		 231 aa  52  0.000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.980511 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2996  phosphate uptake regulator, PhoU  26.98 
 
 		 219 aa  51.2  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2904  phosphate uptake regulator, PhoU  24.38 
 
 		 218 aa  50.1  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.18358  normal  0.0218976 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2889  phosphate uptake regulator, PhoU  24.38 
 
 		 218 aa  50.1  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.114573 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2562  phosphate uptake regulator, PhoU  26.76 
 
 		 223 aa  49.7  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000003122  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1514  phosphate uptake regulator, PhoU  26.76 
 
 		 223 aa  49.7  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.875491  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0380  phosphate uptake regulator, PhoU  25.24 
 
 		 232 aa  49.3  0.00005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0239485  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2864  phosphate uptake regulator, PhoU  22.82 
 
 		 228 aa  49.3  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2971  phosphate uptake regulator, PhoU  23.95 
 
 		 222 aa  48.9  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2105  phosphate uptake regulator, PhoU  26.04 
 
 		 221 aa  48.1  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_150  phosphate transport system regulatory protein  26.99 
 
 		 221 aa  47  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2659  phosphate uptake regulator, PhoU  27.11 
 
 		 222 aa  45.8  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0700  phosphate uptake regulator, PhoU  25.85 
 
 		 219 aa  44.7  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.977876 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1238  phosphate uptake regulator, PhoU  26.45 
 
 		 219 aa  43.1  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.17919  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1415  phosphate uptake regulator, PhoU  21.11 
 
 		 218 aa  43.1  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000133646  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0822  phosphate uptake regulator, PhoU  24.84 
 
 		 240 aa  42.7  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.591011  hitchhiker  0.00503775 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1848  phosphate uptake regulator, PhoU  24.83 
 
 		 223 aa  42.4  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0142  phosphate transport system regulatory protein PhoU  25.77 
 
 		 221 aa  42  0.008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0909  phosphate uptake regulator, PhoU  25 
 
 		 226 aa  42  0.009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0748  phosphate uptake regulator, PhoU  21.32 
 
 		 216 aa  41.6  0.01  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00678381  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>