60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1238 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1238  phosphate uptake regulator, PhoU  100 
 
 		 251 aa  515  1.0000000000000001e-145  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0205293  normal  0.236191 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0948  phosphate uptake regulator, PhoU  79.92 
 
 		 247 aa  413  1e-114  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.478701 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1615  phosphate uptake regulator, PhoU  69.96 
 
 		 243 aa  331  7.000000000000001e-90  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.587621  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1043  phosphate uptake regulator, PhoU  67.07 
 
 		 243 aa  326  2.0000000000000001e-88  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000148702  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1240  transcriptional regulator, putative  68.61 
 
 		 243 aa  315  5e-85  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.448444  normal  0.338031 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1677  phosphate uptake regulator, PhoU  68.78 
 
 		 243 aa  311  4.999999999999999e-84  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0167747  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0973  transcriptional regulator, putative  63.41 
 
 		 243 aa  306  2.0000000000000002e-82  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4118  phosphate uptake regulator, PhoU  24.88 
 
 		 233 aa  62  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1042  phosphate uptake regulator, PhoU  26.96 
 
 		 228 aa  62  0.000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000260045  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4002  phosphate uptake regulator, PhoU  23.83 
 
 		 233 aa  60.8  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.584217  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0422  phosphate uptake regulator, PhoU  23.27 
 
 		 231 aa  59.7  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.980511 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1616  phosphate uptake regulator, PhoU  28.22 
 
 		 228 aa  59.7  0.00000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.46313  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4144  phosphate uptake regulator, PhoU  23.94 
 
 		 233 aa  59.7  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1514  phosphate uptake regulator, PhoU  28.93 
 
 		 223 aa  59.3  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.875491  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2562  phosphate uptake regulator, PhoU  28.93 
 
 		 223 aa  59.3  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000003122  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1678  phosphate uptake regulator, PhoU  26.47 
 
 		 219 aa  58.5  0.00000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00615654  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0380  phosphate uptake regulator, PhoU  26.67 
 
 		 232 aa  57.4  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0239485  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0974  hypothetical protein  26.6 
 
 		 228 aa  56.2  0.0000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1241  hypothetical protein  25.73 
 
 		 228 aa  56.6  0.0000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.375245  normal  0.531566 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2971  phosphate uptake regulator, PhoU  24.75 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1671  phosphate uptake regulator, PhoU  27.68 
 
 		 217 aa  54.3  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000164191  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4578  phosphate uptake regulator, PhoU  23.98 
 
 		 226 aa  53.5  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.92814  normal  0.180696 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2864  phosphate uptake regulator, PhoU  24.76 
 
 		 228 aa  53.1  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2105  phosphate uptake regulator, PhoU  25.62 
 
 		 221 aa  51.2  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1237  phosphate uptake regulator, PhoU  24.02 
 
 		 228 aa  51.2  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.316585  normal  0.224996 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1848  phosphate uptake regulator, PhoU  24.38 
 
 		 223 aa  50.1  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2996  phosphate uptake regulator, PhoU  27.32 
 
 		 219 aa  49.3  0.00006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0947  phosphate uptake regulator, PhoU  28.07 
 
 		 228 aa  49.3  0.00006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.710255 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1095  phosphate transport system regulatory protein PhoU  27.46 
 
 		 228 aa  47.4  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102802  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1415  phosphate uptake regulator, PhoU  23.23 
 
 		 218 aa  47.4  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000133646  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0470  phosphate uptake regulator, PhoU  22.64 
 
 		 222 aa  47.8  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2705  phosphate uptake regulator, PhoU  23.65 
 
 		 229 aa  47.8  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2549  phosphate uptake regulator, PhoU  24.23 
 
 		 226 aa  47  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0645405 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0822  phosphate uptake regulator, PhoU  25.49 
 
 		 240 aa  46.6  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.591011  hitchhiker  0.00503775 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2659  phosphate uptake regulator, PhoU  27.33 
 
 		 222 aa  46.2  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2506  phosphate uptake regulator, PhoU  23.88 
 
 		 223 aa  45.8  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2687  phosphate uptake regulator, PhoU  22.93 
 
 		 231 aa  46.2  0.0006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0840581  normal  0.852923 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2385  phosphate uptake regulator, PhoU  28 
 
 		 221 aa  45.8  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.041607  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_150  phosphate transport system regulatory protein  24.17 
 
 		 221 aa  45.8  0.0006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1929  phosphate uptake regulator, PhoU  25.87 
 
 		 226 aa  45.4  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0982293  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1717  phosphate uptake regulator, PhoU  24.38 
 
 		 223 aa  45.4  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1818  phosphate uptake regulator, PhoU  26.83 
 
 		 230 aa  44.7  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2830  phosphate uptake regulator, PhoU  23.44 
 
 		 220 aa  43.9  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4492  phosphate transporter PhoU  27.5 
 
 		 218 aa  44.3  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3273  phosphate uptake regulator, PhoU  25.48 
 
 		 233 aa  44.7  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0870914  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4170  phosphate transport system regulatory protein PhoU  27.5 
 
 		 218 aa  44.3  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1787  phosphate uptake regulator, PhoU  25.3 
 
 		 226 aa  43.9  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.276553  normal  0.0287996 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4121  phosphate uptake regulator, PhoU  25.89 
 
 		 228 aa  43.9  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0622  phosphate uptake regulator, PhoU  25.48 
 
 		 222 aa  43.5  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4008  phosphate transport system regulatory protein PhoU  27.5 
 
 		 218 aa  43.5  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4288  putative phosphate transport system regulatory protein PhoU  27.5 
 
 		 218 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0302949 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4348  phosphate transport system regulatory protein PhoU, putative  27.5 
 
 		 218 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4401  putative phosphate transport system regulatory protein PhoU  27.5 
 
 		 228 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21540  phosphate uptake regulator, PhoU  26.09 
 
 		 215 aa  42.7  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4018  phosphate transport system regulatory protein  27.5 
 
 		 218 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0909  phosphate uptake regulator, PhoU  24.7 
 
 		 226 aa  42.7  0.006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0659  negative regulator for pho regulon and putative enzyme in phosphate metabolism  20.6 
 
 		 215 aa  42.7  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0489  phosphate uptake regulator, PhoU  25.47 
 
 		 223 aa  42.4  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.762813  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0602  phosphate uptake regulator, PhoU  24.02 
 
 		 243 aa  42  0.009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.226674  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1601  phosphate uptake regulator, PhoU  25.32 
 
 		 216 aa  42  0.01  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000531756  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>