50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0948 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_0948  phosphate uptake regulator, PhoU  100 
 
 
247 aa  508  1e-143  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.478701 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1238  phosphate uptake regulator, PhoU  79.92 
 
 
251 aa  413  1e-114  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0205293  normal  0.236191 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1043  phosphate uptake regulator, PhoU  68.72 
 
 
243 aa  334  9e-91  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000148702  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1615  phosphate uptake regulator, PhoU  68.83 
 
 
243 aa  330  1e-89  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.587621  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1240  transcriptional regulator, putative  65.65 
 
 
243 aa  312  2.9999999999999996e-84  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.448444  normal  0.338031 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1677  phosphate uptake regulator, PhoU  68.33 
 
 
243 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0167747  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0973  transcriptional regulator, putative  62.81 
 
 
243 aa  302  3.0000000000000004e-81  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1042  phosphate uptake regulator, PhoU  28.22 
 
 
228 aa  71.6  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000260045  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1237  phosphate uptake regulator, PhoU  28.44 
 
 
228 aa  68.2  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.316585  normal  0.224996 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1616  phosphate uptake regulator, PhoU  28.22 
 
 
228 aa  67.4  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.46313  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4118  phosphate uptake regulator, PhoU  24.77 
 
 
233 aa  65.9  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0422  phosphate uptake regulator, PhoU  23.65 
 
 
231 aa  64.7  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.980511 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1241  hypothetical protein  27.72 
 
 
228 aa  63.2  0.000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.375245  normal  0.531566 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4144  phosphate uptake regulator, PhoU  23.83 
 
 
233 aa  63.2  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0974  hypothetical protein  27.59 
 
 
228 aa  62.8  0.000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1678  phosphate uptake regulator, PhoU  27.72 
 
 
219 aa  62.8  0.000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00615654  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1671  phosphate uptake regulator, PhoU  27.43 
 
 
217 aa  61.6  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000164191  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4002  phosphate uptake regulator, PhoU  22.9 
 
 
233 aa  60.5  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.584217  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0380  phosphate uptake regulator, PhoU  26.73 
 
 
232 aa  59.7  0.00000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0239485  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2864  phosphate uptake regulator, PhoU  27.54 
 
 
228 aa  58.9  0.00000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2105  phosphate uptake regulator, PhoU  27.45 
 
 
221 aa  55.8  0.0000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1415  phosphate uptake regulator, PhoU  24.24 
 
 
218 aa  54.7  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000133646  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_150  phosphate transport system regulatory protein  24.4 
 
 
221 aa  50.4  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4578  phosphate uptake regulator, PhoU  22.16 
 
 
226 aa  50.1  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.92814  normal  0.180696 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0947  phosphate uptake regulator, PhoU  26.54 
 
 
228 aa  50.1  0.00004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.710255 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2562  phosphate uptake regulator, PhoU  25.18 
 
 
223 aa  48.5  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000003122  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1514  phosphate uptake regulator, PhoU  25.18 
 
 
223 aa  48.5  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.875491  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1080  phosphate uptake regulator, PhoU  24.64 
 
 
219 aa  48.1  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0158991  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1929  phosphate uptake regulator, PhoU  27 
 
 
226 aa  47.8  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0982293  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2659  phosphate uptake regulator, PhoU  25.44 
 
 
222 aa  47.4  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3576  phosphate uptake regulator, PhoU  25.62 
 
 
232 aa  47  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.47067 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2996  phosphate uptake regulator, PhoU  24.04 
 
 
219 aa  46.6  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0091  phosphate uptake regulator, PhoU  23.03 
 
 
231 aa  46.2  0.0005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2385  phosphate uptake regulator, PhoU  27.74 
 
 
221 aa  46.2  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.041607  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2705  phosphate uptake regulator, PhoU  22.17 
 
 
229 aa  45.4  0.0008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1238  phosphate uptake regulator, PhoU  26.99 
 
 
219 aa  45.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.17919  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0470  phosphate uptake regulator, PhoU  26.95 
 
 
222 aa  45.1  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2549  phosphate uptake regulator, PhoU  23.2 
 
 
226 aa  45.1  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0645405 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2340  phosphate uptake regulator, PhoU  22.34 
 
 
239 aa  44.7  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.521848  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0571  phosphate uptake regulator, PhoU  24.75 
 
 
217 aa  44.7  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000468215  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0142  phosphate transport system regulatory protein PhoU  23.44 
 
 
221 aa  45.1  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4348  phosphate transport system regulatory protein PhoU, putative  27.32 
 
 
218 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1482  phosphate uptake regulator, PhoU  23.56 
 
 
225 aa  44.3  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.12558  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4401  putative phosphate transport system regulatory protein PhoU  27.32 
 
 
228 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0983  phosphate uptake regulator, PhoU  25.45 
 
 
216 aa  44.3  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.073439 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0602  phosphate uptake regulator, PhoU  23.04 
 
 
243 aa  43.9  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.226674  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4044  phosphate uptake regulator, PhoU  23.27 
 
 
238 aa  43.1  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4121  phosphate uptake regulator, PhoU  25.62 
 
 
228 aa  42.7  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0115  phosphate uptake regulator, PhoU  22.49 
 
 
234 aa  42.4  0.007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0470  phosphate uptake regulator, PhoU  21.71 
 
 
222 aa  42  0.008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>