41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0973 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_0973  transcriptional regulator, putative  100 
 
 		 243 aa  498  1e-140  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1677  phosphate uptake regulator, PhoU  76.76 
 
 		 243 aa  389  1e-107  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0167747  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1043  phosphate uptake regulator, PhoU  72.61 
 
 		 243 aa  362  2e-99  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000148702  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1615  phosphate uptake regulator, PhoU  71.78 
 
 		 243 aa  360  1e-98  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.587621  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1240  transcriptional regulator, putative  69.83 
 
 		 243 aa  357  9e-98  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.448444  normal  0.338031 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1238  phosphate uptake regulator, PhoU  63.41 
 
 		 251 aa  306  2.0000000000000002e-82  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0205293  normal  0.236191 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0948  phosphate uptake regulator, PhoU  62.81 
 
 		 247 aa  302  3.0000000000000004e-81  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.478701 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1042  phosphate uptake regulator, PhoU  24.88 
 
 		 228 aa  62.4  0.000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000260045  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4118  phosphate uptake regulator, PhoU  23.81 
 
 		 233 aa  57  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4578  phosphate uptake regulator, PhoU  29.25 
 
 		 226 aa  56.6  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.92814  normal  0.180696 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1678  phosphate uptake regulator, PhoU  26.76 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00615654  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0974  hypothetical protein  26.07 
 
 		 228 aa  55.1  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1241  hypothetical protein  25.84 
 
 		 228 aa  55.1  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.375245  normal  0.531566 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4002  phosphate uptake regulator, PhoU  23.33 
 
 		 233 aa  53.9  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.584217  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0422  phosphate uptake regulator, PhoU  22.86 
 
 		 231 aa  54.3  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.980511 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4144  phosphate uptake regulator, PhoU  22.86 
 
 		 233 aa  54.3  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1616  phosphate uptake regulator, PhoU  25.87 
 
 		 228 aa  53.9  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.46313  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2864  phosphate uptake regulator, PhoU  25.13 
 
 		 228 aa  53.1  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2971  phosphate uptake regulator, PhoU  26.79 
 
 		 222 aa  51.2  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1514  phosphate uptake regulator, PhoU  28.99 
 
 		 223 aa  51.2  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.875491  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2562  phosphate uptake regulator, PhoU  28.99 
 
 		 223 aa  51.2  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000003122  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1671  phosphate uptake regulator, PhoU  24.75 
 
 		 217 aa  51.2  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000164191  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0380  phosphate uptake regulator, PhoU  27.57 
 
 		 232 aa  51.6  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0239485  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1237  phosphate uptake regulator, PhoU  23.5 
 
 		 228 aa  49.3  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.316585  normal  0.224996 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1238  phosphate uptake regulator, PhoU  27.74 
 
 		 219 aa  47.4  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.17919  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1929  phosphate uptake regulator, PhoU  24.86 
 
 		 226 aa  46.6  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0982293  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0622  phosphate uptake regulator, PhoU  27.74 
 
 		 222 aa  45.8  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0091  phosphate uptake regulator, PhoU  26.58 
 
 		 231 aa  45.8  0.0007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0909  phosphate uptake regulator, PhoU  24.49 
 
 		 226 aa  45.1  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2105  phosphate uptake regulator, PhoU  23.23 
 
 		 221 aa  44.3  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0659  negative regulator for pho regulon and putative enzyme in phosphate metabolism  22.82 
 
 		 215 aa  44.3  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1848  phosphate uptake regulator, PhoU  26.81 
 
 		 223 aa  44.3  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0115  phosphate uptake regulator, PhoU  25.6 
 
 		 234 aa  43.5  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1095  phosphate transport system regulatory protein PhoU  26.06 
 
 		 228 aa  43.5  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102802  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2346  phosphate uptake regulator, PhoU  26.17 
 
 		 224 aa  43.1  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0217028 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3442  phosphate uptake regulator, PhoU  23.46 
 
 		 225 aa  43.1  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1415  phosphate uptake regulator, PhoU  24.68 
 
 		 218 aa  42.7  0.006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000133646  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1601  phosphate uptake regulator, PhoU  24.71 
 
 		 216 aa  42.7  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000531756  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2996  phosphate uptake regulator, PhoU  25.73 
 
 		 219 aa  42  0.009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_150  phosphate transport system regulatory protein  25.57 
 
 		 221 aa  42  0.009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2362  phosphate uptake regulator, PhoU  23.9 
 
 		 219 aa  42  0.01  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.488645  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>