33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0016 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_0016  NADPH-dependent FMN reductase  100 
 
 
356 aa  739    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.253639 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0028  NADPH-dependent FMN reductase  83.43 
 
 
356 aa  630  1e-180  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0016  NADPH-dependent FMN reductase  74.01 
 
 
363 aa  551  1e-156  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0120399  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0075  hypothetical protein  67.61 
 
 
367 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.652884  hitchhiker  0.00157318 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5240  NADPH-dependent FMN reductase  65.17 
 
 
368 aa  498  1e-140  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.88233  normal  0.0581864 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4380  hypothetical protein  66.2 
 
 
373 aa  487  1e-136  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.186709  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5588  hypothetical protein  57.06 
 
 
366 aa  422  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.256684  hitchhiker  0.00697782 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4195  hypothetical protein  59.87 
 
 
327 aa  399  9.999999999999999e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5263  hypothetical protein  36.18 
 
 
306 aa  102  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.796314  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3301  hypothetical protein  34.29 
 
 
263 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.109724 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1063  NADPH-dependent FMN reductase  22.18 
 
 
186 aa  52  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2017  hypothetical protein  23.12 
 
 
236 aa  52  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.499151  normal  0.173884 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1035  NADPH-dependent FMN reductase  23.43 
 
 
186 aa  50.4  0.00004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2302  iron-sulfur flavoprotein  27.48 
 
 
192 aa  49.7  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.52552  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1822  iron-sulfur flavoprotein  24.5 
 
 
193 aa  48.1  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000643052  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1561  NADPH-dependent FMN reductase  26.28 
 
 
206 aa  48.5  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000524537 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1785  NADPH-dependent FMN reductase  26.28 
 
 
210 aa  48.5  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000137448 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0629  multimeric flavodoxin WrbA-like  27.48 
 
 
226 aa  47.8  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.155338  normal  0.090437 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1149  NADPH-dependent FMN reductase  27.78 
 
 
208 aa  47.4  0.0004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.285301  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0133  NADPH-dependent FMN reductase  35.21 
 
 
191 aa  47  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000492716  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1251  NADPH-dependent FMN reductase  22.95 
 
 
186 aa  47  0.0005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18210  NADPH-dependent FMN reductase  25.53 
 
 
177 aa  47  0.0005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1492  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  26.98 
 
 
540 aa  47  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1988  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  33.82 
 
 
321 aa  46.6  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0292793  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0727  NADPH-dependent FMN reductase  26.49 
 
 
204 aa  46.2  0.0008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3141  iron-sulfur flavoprotein  29.41 
 
 
178 aa  46.6  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.087899  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1131  hypothetical protein  34.78 
 
 
179 aa  44.3  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0988  NADPH-dependent FMN reductase  25.79 
 
 
294 aa  44.3  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.327411  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0158  NADPH-dependent FMN reductase  25.2 
 
 
193 aa  43.5  0.005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0621741 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1378  iron-sulfur flavoprotein  25.95 
 
 
185 aa  43.9  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1744  NADPH-dependent FMN reductase  26.02 
 
 
193 aa  43.5  0.006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0255848  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2184  iron-sulfur flavoprotein, putative  30.61 
 
 
201 aa  43.5  0.006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0986799  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1619  NADPH-dependent FMN reductase  39.58 
 
 
179 aa  43.1  0.007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.188909 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>