68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_2017 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_2017  hypothetical protein  100 
 
 		 236 aa  497  1e-140  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.499151  normal  0.173884 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1161  Rieske (2Fe-2S) domain protein  37.56 
 
 		 374 aa  135  5e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000071782  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1830  Multimeric flavodoxin WrbA-like protein  26.35 
 
 		 192 aa  73.6  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00348996  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10403  hypothetical protein  25.89 
 
 		 236 aa  72.4  0.000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2691  hypothetical protein  27.31 
 
 		 234 aa  72  0.000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.805615 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10943  hypothetical protein  25.81 
 
 		 245 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2720  hypothetical protein  26.14 
 
 		 240 aa  70.5  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00344324 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3009  hypothetical protein  26.88 
 
 		 249 aa  69.7  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.932939  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0629  multimeric flavodoxin WrbA-like  25.61 
 
 		 226 aa  69.3  0.00000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.155338  normal  0.090437 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2466  hypothetical protein  25.6 
 
 		 243 aa  67.8  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00315756  hitchhiker  0.00463895 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7142  hypothetical protein  26.97 
 
 		 205 aa  68.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5993  hypothetical protein  24.27 
 
 		 205 aa  65.9  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0417  NADPH-dependent FMN reductase  22.33 
 
 		 205 aa  64.7  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5240  NADPH-dependent FMN reductase  24.06 
 
 		 368 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.88233  normal  0.0581864 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4291  hypothetical protein  26.04 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0075  hypothetical protein  23.96 
 
 		 367 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.652884  hitchhiker  0.00157318 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0810  BRAMP  24.75 
 
 		 233 aa  58.5  0.00000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.22904  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1423  hypothetical protein  25 
 
 		 248 aa  55.1  0.0000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4745  hypothetical protein  20.56 
 
 		 206 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0316  NADPH-dependent FMN reductase  30 
 
 		 212 aa  54.7  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0016  NADPH-dependent FMN reductase  23.44 
 
 		 363 aa  52.8  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0120399  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4864  hypothetical protein  22.15 
 
 		 201 aa  52.4  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0588631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2010  NADPH-dependent FMN reductase  29.22 
 
 		 207 aa  52.4  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000015054  normal  0.204616 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0772  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  26.67 
 
 		 193 aa  52.4  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.806618  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2466  hypothetical protein  29.71 
 
 		 214 aa  52  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0016  NADPH-dependent FMN reductase  23.12 
 
 		 356 aa  52  0.000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.253639 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0050  NADPH-dependent FMN reductase  26.09 
 
 		 183 aa  51.2  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0452  NADPH-dependent FMN reductase  23.29 
 
 		 211 aa  50.4  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1132  hypothetical protein  25.2 
 
 		 212 aa  50.1  0.00003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4195  hypothetical protein  27.91 
 
 		 327 aa  49.7  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5588  hypothetical protein  21.79 
 
 		 366 aa  48.9  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.256684  hitchhiker  0.00697782 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1182  NADPH-dependent FMN reductase  34.23 
 
 		 190 aa  48.9  0.00006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000238882  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1822  iron-sulfur flavoprotein  24.19 
 
 		 193 aa  48.5  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000643052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1125  NADPH-dependent FMN reductase  26.36 
 
 		 217 aa  48.1  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000715162  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1371  NADPH-dependent FMN reductase  34.23 
 
 		 190 aa  48.1  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000814349  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2077  BRAMP  23.08 
 
 		 216 aa  48.1  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00766184  normal  0.590504 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0028  NADPH-dependent FMN reductase  21.61 
 
 		 356 aa  48.1  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1152  NADPH-dependent FMN reductase  34.23 
 
 		 190 aa  47  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000059068  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0158  NADPH-dependent FMN reductase  26.98 
 
 		 206 aa  47  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0325  NADPH-dependent FMN reductase  24.5 
 
 		 188 aa  46.2  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.538319 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2732  NADPH-dependent FMN reductase  27.34 
 
 		 209 aa  45.8  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0893  NADPH-dependent FMN reductase  24.09 
 
 		 200 aa  45.4  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4331  manganese transport protein  20.74 
 
 		 201 aa  45.4  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1149  NADPH-dependent FMN reductase  25.22 
 
 		 208 aa  44.3  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.285301  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2997  NADPH-dependent FMN reductase  25.45 
 
 		 184 aa  44.3  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0315889  normal  0.693807 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1057  NADPH-dependent FMN reductase  21.29 
 
 		 190 aa  44.3  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.840292  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1561  NADPH-dependent FMN reductase  27.83 
 
 		 206 aa  43.9  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000524537 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0130  NADPH-dependent FMN reductase  25 
 
 		 224 aa  43.9  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1785  NADPH-dependent FMN reductase  25.22 
 
 		 210 aa  44.3  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000137448 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1351  NADPH-dependent FMN reductase  23.33 
 
 		 187 aa  43.5  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1584  NADPH-dependent FMN reductase  25.23 
 
 		 220 aa  43.1  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1184  NADPH-dependent FMN reductase  22.32 
 
 		 223 aa  43.1  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.44131  normal  0.152042 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1029  NADPH-dependent FMN reductase  24.55 
 
 		 222 aa  43.1  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.153649  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1969  hypothetical protein  21.05 
 
 		 207 aa  43.1  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.256176  normal  0.256404 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0018  NADPH-dependent FMN reductase  27.03 
 
 		 228 aa  43.1  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3308  NADPH-dependent FMN reductase  26.92 
 
 		 311 aa  42.7  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000769762  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1251  NADPH-dependent FMN reductase  23.03 
 
 		 186 aa  42.7  0.005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0158  NADPH-dependent FMN reductase  22.12 
 
 		 193 aa  42.4  0.006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0621741 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1744  NADPH-dependent FMN reductase  21.53 
 
 		 193 aa  42.4  0.006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0255848  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1029  iron-sulfur flavoprotein  21.71 
 
 		 190 aa  42.4  0.006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.343926  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0010  NADPH-dependent FMN reductase  23.81 
 
 		 194 aa  42.4  0.006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.21951  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2302  iron-sulfur flavoprotein  23.31 
 
 		 192 aa  42.4  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.52552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0718  NADPH-dependent FMN reductase  22.6 
 
 		 193 aa  42  0.008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1072  NADPH-dependent FMN reductase  26.32 
 
 		 212 aa  42  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0455  NADPH-dependent FMN reductase  21.85 
 
 		 204 aa  42  0.008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0622155  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2564  hypothetical protein  22.22 
 
 		 209 aa  42  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1046  hypothetical protein  26.36 
 
 		 187 aa  41.6  0.01  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.882215 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1241  NADPH-dependent FMN reductase  24.18 
 
 		 189 aa  41.6  0.01  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>