16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4380 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B4380  hypothetical protein  100 
 
 
373 aa  763    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.186709  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0075  hypothetical protein  70.09 
 
 
367 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.652884  hitchhiker  0.00157318 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0028  NADPH-dependent FMN reductase  65.92 
 
 
356 aa  488  1e-137  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0016  NADPH-dependent FMN reductase  66.2 
 
 
356 aa  487  1e-136  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.253639 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5240  NADPH-dependent FMN reductase  64.48 
 
 
368 aa  484  1e-136  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.88233  normal  0.0581864 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0016  NADPH-dependent FMN reductase  66.57 
 
 
363 aa  483  1e-135  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0120399  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5588  hypothetical protein  53.85 
 
 
366 aa  409  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.256684  hitchhiker  0.00697782 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4195  hypothetical protein  58.18 
 
 
327 aa  402  1e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5263  hypothetical protein  34.62 
 
 
306 aa  96.7  7e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.796314  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3301  hypothetical protein  37.59 
 
 
263 aa  88.6  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.109724 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1285  NADPH-dependent FMN reductase  25.78 
 
 
197 aa  51.6  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.497649  normal  0.389555 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1132  hypothetical protein  31.4 
 
 
212 aa  47  0.0006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1561  NADPH-dependent FMN reductase  27.38 
 
 
206 aa  46.2  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000524537 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18210  NADPH-dependent FMN reductase  28.81 
 
 
177 aa  45.4  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0727  NADPH-dependent FMN reductase  26.13 
 
 
204 aa  43.1  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1785  NADPH-dependent FMN reductase  28 
 
 
210 aa  43.5  0.007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000137448 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>