26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5240 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_5240  NADPH-dependent FMN reductase  100 
 
 
368 aa  766    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.88233  normal  0.0581864 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0075  hypothetical protein  72.32 
 
 
367 aa  535  1e-151  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.652884  hitchhiker  0.00157318 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0028  NADPH-dependent FMN reductase  66.29 
 
 
356 aa  509  1e-143  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0016  NADPH-dependent FMN reductase  65.17 
 
 
356 aa  498  1e-140  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.253639 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4380  hypothetical protein  64.48 
 
 
373 aa  484  1e-136  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.186709  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0016  NADPH-dependent FMN reductase  63.23 
 
 
363 aa  481  1e-135  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0120399  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5588  hypothetical protein  50.55 
 
 
366 aa  385  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.256684  hitchhiker  0.00697782 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4195  hypothetical protein  53.29 
 
 
327 aa  362  5.0000000000000005e-99  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5263  hypothetical protein  33.33 
 
 
306 aa  95.9  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.796314  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3301  hypothetical protein  35.86 
 
 
263 aa  86.7  5e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.109724 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2017  hypothetical protein  24.06 
 
 
236 aa  62.4  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.499151  normal  0.173884 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1285  NADPH-dependent FMN reductase  26.97 
 
 
197 aa  52.8  0.000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.497649  normal  0.389555 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1822  iron-sulfur flavoprotein  28 
 
 
193 aa  52.4  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000643052  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0158  NADPH-dependent FMN reductase  24.39 
 
 
193 aa  49.7  0.00009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0621741 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1744  NADPH-dependent FMN reductase  25.2 
 
 
193 aa  49.3  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0255848  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0718  NADPH-dependent FMN reductase  25.2 
 
 
193 aa  47.8  0.0003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18210  NADPH-dependent FMN reductase  25.56 
 
 
177 aa  46.6  0.0007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0010  NADPH-dependent FMN reductase  30.23 
 
 
194 aa  46.2  0.0008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.21951  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2659  NADPH-dependent FMN reductase  25.85 
 
 
205 aa  45.4  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.385785 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0078  NADPH-dependent FMN reductase  26.42 
 
 
193 aa  44.7  0.003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.45768  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0408  NADPH-dependent FMN reductase  27.42 
 
 
225 aa  43.9  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1815  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  27.64 
 
 
224 aa  43.9  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1584  NADPH-dependent FMN reductase  26.61 
 
 
220 aa  43.5  0.006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2261  NADPH-dependent FMN reductase  27.42 
 
 
222 aa  43.1  0.007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.224265  normal  0.127615 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1132  hypothetical protein  27.91 
 
 
212 aa  42.7  0.009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0727  NADPH-dependent FMN reductase  23.62 
 
 
204 aa  42.7  0.01  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>