25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_4195 on replicon NC_007959
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007959  Nham_4195  hypothetical protein  100 
 
 		 327 aa  682    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5588  hypothetical protein  65.75 
 
 		 366 aa  454  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.256684  hitchhiker  0.00697782 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4380  hypothetical protein  58.18 
 
 		 373 aa  402  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.186709  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0016  NADPH-dependent FMN reductase  58.51 
 
 		 363 aa  399  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0120399  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0016  NADPH-dependent FMN reductase  59.87 
 
 		 356 aa  399  9.999999999999999e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.253639 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0028  NADPH-dependent FMN reductase  55.89 
 
 		 356 aa  390  1e-107  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5240  NADPH-dependent FMN reductase  53.29 
 
 		 368 aa  362  4e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.88233  normal  0.0581864 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0075  hypothetical protein  54.31 
 
 		 367 aa  360  2e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.652884  hitchhiker  0.00157318 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5263  hypothetical protein  36.41 
 
 		 306 aa  99.8  6e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.796314  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3301  hypothetical protein  40.44 
 
 		 263 aa  89  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.109724 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1822  iron-sulfur flavoprotein  26.89 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000643052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2302  iron-sulfur flavoprotein  26.52 
 
 		 192 aa  52  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.52552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2017  hypothetical protein  27.91 
 
 		 236 aa  49.7  0.00007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.499151  normal  0.173884 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1057  NADPH-dependent FMN reductase  25.81 
 
 		 190 aa  48.1  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.840292  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0629  multimeric flavodoxin WrbA-like  25.87 
 
 		 226 aa  48.1  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.155338  normal  0.090437 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1029  iron-sulfur flavoprotein  25.81 
 
 		 190 aa  47  0.0005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.343926  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0755  NADPH-dependent FMN reductase  29.29 
 
 		 213 aa  45.4  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.263848  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1285  NADPH-dependent FMN reductase  25.81 
 
 		 197 aa  45.8  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.497649  normal  0.389555 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1988  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  34.29 
 
 		 321 aa  44.7  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0292793  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1043  NADPH-dependent FMN reductase  24.19 
 
 		 192 aa  43.9  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.603654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3773  NADPH-dependent FMN reductase  27.42 
 
 		 220 aa  44.3  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.65168  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1351  NADPH-dependent FMN reductase  26.07 
 
 		 187 aa  44.3  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3857  NADPH-dependent FMN reductase  27.42 
 
 		 220 aa  43.9  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00910864 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1584  NADPH-dependent FMN reductase  27.78 
 
 		 220 aa  43.9  0.004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1244  NADPH-dependent FMN reductase  23.39 
 
 		 190 aa  42.7  0.008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>