35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0075 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0075  hypothetical protein  100 
 
 		 367 aa  766    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.652884  hitchhiker  0.00157318 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5240  NADPH-dependent FMN reductase  72.32 
 
 		 368 aa  535  1e-151  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.88233  normal  0.0581864 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4380  hypothetical protein  70.09 
 
 		 373 aa  505  9.999999999999999e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.186709  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0016  NADPH-dependent FMN reductase  67.61 
 
 		 356 aa  504  9.999999999999999e-143  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.253639 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0028  NADPH-dependent FMN reductase  65.63 
 
 		 356 aa  498  1e-140  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0016  NADPH-dependent FMN reductase  65.73 
 
 		 363 aa  487  1e-136  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0120399  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5588  hypothetical protein  53.67 
 
 		 366 aa  403  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.256684  hitchhiker  0.00697782 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4195  hypothetical protein  54.31 
 
 		 327 aa  360  2e-98  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5263  hypothetical protein  34.39 
 
 		 306 aa  97.1  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.796314  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3301  hypothetical protein  31.55 
 
 		 263 aa  89.7  6e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.109724 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2017  hypothetical protein  23.96 
 
 		 236 aa  58.9  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.499151  normal  0.173884 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0727  NADPH-dependent FMN reductase  25 
 
 		 204 aa  55.8  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0133  NADPH-dependent FMN reductase  36.11 
 
 		 191 aa  51.2  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000492716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2302  iron-sulfur flavoprotein  26.72 
 
 		 192 aa  50.4  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.52552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1285  NADPH-dependent FMN reductase  23.84 
 
 		 197 aa  50.1  0.00006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.497649  normal  0.389555 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0010  NADPH-dependent FMN reductase  30.3 
 
 		 194 aa  48.5  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.21951  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0158  NADPH-dependent FMN reductase  26.02 
 
 		 193 aa  47.8  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0621741 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1744  NADPH-dependent FMN reductase  26.02 
 
 		 193 aa  47.4  0.0004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0255848  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18210  NADPH-dependent FMN reductase  29.21 
 
 		 177 aa  47  0.0005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1584  NADPH-dependent FMN reductase  26.61 
 
 		 220 aa  47  0.0005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3305  iron-sulfur flavoprotein  27.42 
 
 		 222 aa  46.6  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.328284  normal  0.134625 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0718  NADPH-dependent FMN reductase  26.02 
 
 		 193 aa  45.8  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1035  NADPH-dependent FMN reductase  30.16 
 
 		 186 aa  45.4  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1139  NADPH-dependent FMN reductase  28.09 
 
 		 182 aa  44.3  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.628109  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1251  NADPH-dependent FMN reductase  30.08 
 
 		 186 aa  44.7  0.003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1561  NADPH-dependent FMN reductase  27.16 
 
 		 206 aa  43.9  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000524537 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1063  NADPH-dependent FMN reductase  20.91 
 
 		 186 aa  44.3  0.004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1442  NADPH-dependent FMN reductase  26.85 
 
 		 224 aa  43.9  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.103462  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0938  NADPH-dependent FMN reductase  30 
 
 		 220 aa  43.9  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0316  NADPH-dependent FMN reductase  26.02 
 
 		 212 aa  43.9  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1043  NADPH-dependent FMN reductase  23.58 
 
 		 192 aa  43.5  0.006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.603654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0078  NADPH-dependent FMN reductase  27.06 
 
 		 193 aa  43.1  0.008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.45768  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1132  hypothetical protein  27.06 
 
 		 212 aa  43.1  0.008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1492  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  24.6 
 
 		 540 aa  42.7  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1241  NADPH-dependent FMN reductase  32.89 
 
 		 189 aa  42.7  0.01  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>