14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5263 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_5263  hypothetical protein  100 
 
 
306 aa  633  1e-180  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.796314  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3301  hypothetical protein  85.88 
 
 
263 aa  483  1e-135  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.109724 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0016  NADPH-dependent FMN reductase  36.18 
 
 
356 aa  102  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.253639 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0028  NADPH-dependent FMN reductase  35.56 
 
 
356 aa  100  4e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4195  hypothetical protein  36.41 
 
 
327 aa  99.8  5e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0075  hypothetical protein  34.39 
 
 
367 aa  97.1  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.652884  hitchhiker  0.00157318 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4380  hypothetical protein  34.62 
 
 
373 aa  96.7  5e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.186709  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5588  hypothetical protein  33.67 
 
 
366 aa  96.3  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.256684  hitchhiker  0.00697782 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5240  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 
368 aa  95.9  8e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.88233  normal  0.0581864 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0016  NADPH-dependent FMN reductase  34.97 
 
 
363 aa  90.5  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0120399  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1561  NADPH-dependent FMN reductase  26.98 
 
 
206 aa  47.4  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000524537 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0333  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.94 
 
 
222 aa  47.4  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.977725  normal  0.107763 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1636  NADPH-dependent FMN reductase  41.18 
 
 
214 aa  46.2  0.0008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1131  hypothetical protein  26.23 
 
 
179 aa  43.5  0.004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>