33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0016 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0016  NADPH-dependent FMN reductase  100 
 
 		 363 aa  749    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0120399  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0028  NADPH-dependent FMN reductase  75.14 
 
 		 356 aa  560  1e-158  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0016  NADPH-dependent FMN reductase  74.01 
 
 		 356 aa  551  1e-156  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.253639 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0075  hypothetical protein  65.73 
 
 		 367 aa  487  1e-136  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.652884  hitchhiker  0.00157318 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4380  hypothetical protein  66.57 
 
 		 373 aa  483  1e-135  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.186709  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5240  NADPH-dependent FMN reductase  63.23 
 
 		 368 aa  481  1e-135  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.88233  normal  0.0581864 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5588  hypothetical protein  57.63 
 
 		 366 aa  427  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.256684  hitchhiker  0.00697782 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4195  hypothetical protein  58.51 
 
 		 327 aa  399  9.999999999999999e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5263  hypothetical protein  34.97 
 
 		 306 aa  90.5  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.796314  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3301  hypothetical protein  32.93 
 
 		 263 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.109724 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2302  iron-sulfur flavoprotein  28.24 
 
 		 192 aa  54.7  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.52552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2017  hypothetical protein  23.44 
 
 		 236 aa  52.8  0.000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.499151  normal  0.173884 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1043  NADPH-dependent FMN reductase  26.83 
 
 		 192 aa  50.1  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.603654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0727  NADPH-dependent FMN reductase  26.57 
 
 		 204 aa  48.5  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0722  NADPH-dependent FMN reductase  26.72 
 
 		 211 aa  47.8  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.658969  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1385  iron-sulfur flavoprotein  28.8 
 
 		 191 aa  47.8  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1623  hypothetical protein  25.2 
 
 		 194 aa  46.6  0.0006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1285  NADPH-dependent FMN reductase  25 
 
 		 197 aa  46.6  0.0007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.497649  normal  0.389555 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18210  NADPH-dependent FMN reductase  26.39 
 
 		 177 aa  46.2  0.0008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1029  NADPH-dependent FMN reductase  25 
 
 		 222 aa  45.1  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.153649  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2158  NADPH-dependent FMN reductase  29.84 
 
 		 205 aa  44.3  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2925  NADPH-dependent FMN reductase  26.83 
 
 		 193 aa  44.3  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000194359  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0650  NADPH-dependent FMN reductase  25.98 
 
 		 190 aa  43.5  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1057  NADPH-dependent FMN reductase  22.76 
 
 		 190 aa  43.9  0.005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.840292  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1441  NADPH-dependent FMN reductase  26.02 
 
 		 192 aa  43.5  0.006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.517367  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1751  NADPH-dependent FMN reductase  26.02 
 
 		 208 aa  43.5  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0455  NADPH-dependent FMN reductase  28.57 
 
 		 204 aa  43.5  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0622155  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3305  iron-sulfur flavoprotein  25.2 
 
 		 222 aa  43.5  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.328284  normal  0.134625 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0487  NADPH-dependent FMN reductase  23.83 
 
 		 199 aa  43.1  0.008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.671634  normal  0.453927 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1264  NADPH-dependent FMN reductase  23.58 
 
 		 200 aa  43.1  0.008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.246056  normal  0.0622096 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1184  NADPH-dependent FMN reductase  28.46 
 
 		 223 aa  42.7  0.009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.44131  normal  0.152042 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0179  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  23.66 
 
 		 211 aa  42.7  0.009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1029  iron-sulfur flavoprotein  24 
 
 		 190 aa  42.7  0.009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.343926  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>