18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5588 on replicon NC_012853
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012853  Rleg_5588  hypothetical protein  100 
 
 		 366 aa  765    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.256684  hitchhiker  0.00697782 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4195  hypothetical protein  65.75 
 
 		 327 aa  469  1.0000000000000001e-131  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0016  NADPH-dependent FMN reductase  57.06 
 
 		 356 aa  434  1e-121  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.253639 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0016  NADPH-dependent FMN reductase  57.63 
 
 		 363 aa  437  1e-121  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0120399  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4380  hypothetical protein  53.85 
 
 		 373 aa  422  1e-117  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.186709  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0028  NADPH-dependent FMN reductase  54.55 
 
 		 356 aa  419  1e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0075  hypothetical protein  53.67 
 
 		 367 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.652884  hitchhiker  0.00157318 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5240  NADPH-dependent FMN reductase  50.55 
 
 		 368 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.88233  normal  0.0581864 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5263  hypothetical protein  33.67 
 
 		 306 aa  96.3  7e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.796314  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3301  hypothetical protein  35.04 
 
 		 263 aa  77.4  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.109724 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2017  hypothetical protein  21.79 
 
 		 236 aa  49.3  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.499151  normal  0.173884 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0629  multimeric flavodoxin WrbA-like  26.4 
 
 		 226 aa  47.8  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.155338  normal  0.090437 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1285  NADPH-dependent FMN reductase  24.22 
 
 		 197 aa  47  0.0005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.497649  normal  0.389555 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1822  iron-sulfur flavoprotein  31.2 
 
 		 193 aa  46.6  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000643052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2302  iron-sulfur flavoprotein  28.24 
 
 		 192 aa  46.6  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.52552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1584  NADPH-dependent FMN reductase  27.42 
 
 		 220 aa  43.9  0.004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1184  NADPH-dependent FMN reductase  26.61 
 
 		 223 aa  43.1  0.008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.44131  normal  0.152042 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1029  NADPH-dependent FMN reductase  25 
 
 		 222 aa  42.7  0.009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.153649  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>