111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_2121 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_2121  chorismate mutase, putative  100 
 
 		 109 aa  224  3e-58  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2904  Chorismate mutase  58.88 
 
 		 109 aa  132  9.999999999999999e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0046  chorismate mutase, putative  56.44 
 
 		 108 aa  117  3.9999999999999996e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.52978  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2533  Chorismate mutase  57.58 
 
 		 108 aa  117  4.9999999999999996e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2274  Chorismate mutase  60 
 
 		 108 aa  112  2.0000000000000002e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2513  Chorismate mutase  59.38 
 
 		 107 aa  110  6e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.514651  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2732  chorismate mutase  59.14 
 
 		 107 aa  110  9e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0378476  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3022  chorismate mutase  36.36 
 
 		 360 aa  53.9  0.0000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.123559  normal  0.97386 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2267  Chorismate mutase  35.9 
 
 		 121 aa  52.4  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.577678  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1193  chorismate mutase  35.87 
 
 		 366 aa  52  0.000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2998  bifunctional 3-deoxy-7-phosphoheptulonate synthase/chorismate mutase  34.94 
 
 		 358 aa  51.2  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.746769  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2698  bifunctional 3-deoxy-7-phosphoheptulonate synthase/chorismate mutase  34.94 
 
 		 358 aa  51.6  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2677  bifunctional 3-deoxy-7-phosphoheptulonate synthase/chorismate mutase  34.94 
 
 		 358 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.907033  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3004  bifunctional 3-deoxy-7-phosphoheptulonate synthase/chorismate mutase  34.94 
 
 		 358 aa  51.2  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.18443  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2960  bifunctional 3-deoxy-7-phosphoheptulonate synthase/chorismate mutase  34.94 
 
 		 358 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2280  bifunctional 3-deoxy-7-phosphoheptulonate synthase/chorismate mutase  34.94 
 
 		 358 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000102751 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2748  bifunctional 3-deoxy-7-phosphoheptulonate synthase/chorismate mutase  34.94 
 
 		 358 aa  51.2  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.531887  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2958  bifunctional 3-deoxy-7-phosphoheptulonate synthase/chorismate mutase  34.94 
 
 		 358 aa  51.2  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0331892  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2957  bifunctional 3-deoxy-7-phosphoheptulonate synthase/chorismate mutase  34.94 
 
 		 358 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.64747e-16 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2014  bifunctional 3-deoxy-7-phosphoheptulonate synthase/chorismate mutase  35.9 
 
 		 358 aa  50.8  0.000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00348159  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2751  bifunctional 3-deoxy-7-phosphoheptulonate synthase/chorismate mutase  34.94 
 
 		 358 aa  50.8  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.601469  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2723  chorismate mutase  36.9 
 
 		 381 aa  48.9  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2583  prephenate dehydratase  35.79 
 
 		 372 aa  49.3  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0793  chorismate mutase  28.12 
 
 		 374 aa  48.9  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.66734e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0540  hypothetical protein  34.15 
 
 		 91 aa  48.5  0.00003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0000524259  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0564  chorismate mutase  32.93 
 
 		 362 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1146  hypothetical protein  31.71 
 
 		 90 aa  48.5  0.00003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0377196  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1043  chorismate mutase  32.93 
 
 		 360 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1244  prephenate dehydratase / chorismate mutase  35.16 
 
 		 371 aa  48.1  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0482068  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1345  prephenate dehydratase  30.21 
 
 		 379 aa  47.4  0.00006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1538  chorismate mutase  32.1 
 
 		 362 aa  47.4  0.00006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0432  chorismate mutase/prephenate dehydratase  33.33 
 
 		 360 aa  47.4  0.00007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2997  chorismate mutase/prephenate dehydratase  33.33 
 
 		 360 aa  47.4  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.379619  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1635  chorismate mutase/prephenate dehydratase  33.33 
 
 		 360 aa  47.4  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2575  chorismate mutase/prephenate dehydratase  33.33 
 
 		 360 aa  47.4  0.00007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0950  chorismate mutase/prephenate dehydratase  33.33 
 
 		 360 aa  47.4  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2885  chorismate mutase/prephenate dehydratase  33.33 
 
 		 360 aa  47.4  0.00007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.629426  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2948  chorismate mutase/prephenate dehydratase  33.33 
 
 		 360 aa  47.4  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.457884  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0198  chorismate mutase/prephenate dehydratase  33.33 
 
 		 360 aa  47.4  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0741  chorismate mutase  31.71 
 
 		 360 aa  47  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4156  prephenate dehydratase / chorismate mutase  31.71 
 
 		 360 aa  46.2  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2241  prephenate dehydratase / chorismate mutase  31.17 
 
 		 370 aa  46.6  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1666  P-protein  37.29 
 
 		 359 aa  46.6  0.0001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0216  chorismate mutase  39.62 
 
 		 355 aa  46.6  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1002  chorismate mutase  31.71 
 
 		 360 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3006  chorismate mutase  30.59 
 
 		 360 aa  46.2  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.224868  normal  0.0525817 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0977  prephenate dehydratase / chorismate mutase  30.59 
 
 		 360 aa  46.2  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.23904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1207  chorismate mutase  32 
 
 		 371 aa  45.4  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.196084  normal  0.0297935 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0961  chorismate mutase  33.78 
 
 		 374 aa  45.8  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2261  chorismate mutase  30.49 
 
 		 360 aa  45.1  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.561054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2575  prephenate dehydratase  33.33 
 
 		 382 aa  44.7  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0965398  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0919  chorismate mutase  30.49 
 
 		 360 aa  44.7  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0585516  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2509  hypothetical protein  34.94 
 
 		 90 aa  45.1  0.0004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2858  chorismate mutase  34.62 
 
 		 373 aa  45.1  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.42066  hitchhiker  0.0000000270068 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0923  chorismate mutase  30.49 
 
 		 360 aa  44.7  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.432858 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1019  chorismate mutase  35.53 
 
 		 358 aa  44.7  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.789998  unclonable  0.0000000000373166 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0897  chorismate mutase/prephenate dehydratase  35.53 
 
 		 358 aa  44.7  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.255743  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1360  chorismate mutase/prephenate dehydratase  30 
 
 		 357 aa  44.3  0.0005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1589  transcription termination factor NusA  38.18 
 
 		 359 aa  44.3  0.0006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1588  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  37.93 
 
 		 375 aa  43.9  0.0008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2488  chorismate mutase  26.44 
 
 		 91 aa  43.9  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0716  prephenate dehydratase / chorismate mutase  33.71 
 
 		 387 aa  43.5  0.0009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00716  P-protein  36.11 
 
 		 402 aa  43.5  0.0009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00262272  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1243  Chorismate mutase  33.71 
 
 		 97 aa  43.1  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4076  prephenate dehydratase  33.33 
 
 		 364 aa  43.5  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000787581  normal  0.246318 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0269  chorismate mutase/prephenate dehydratase  31.25 
 
 		 358 aa  43.5  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1068  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  31.4 
 
 		 384 aa  43.1  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0518794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0495  chorismate mutase  28.24 
 
 		 359 aa  42.7  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0778684  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1177  chorismate mutase  31.91 
 
 		 659 aa  42.7  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0227  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  33.33 
 
 		 375 aa  42.7  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1313  chorismate mutase  27.91 
 
 		 359 aa  43.1  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.21838e-16 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3039  chorismate mutase  34.67 
 
 		 355 aa  42.7  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1336  chorismate mutase  32.47 
 
 		 413 aa  42  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0783  prephenate dehydratase  30.59 
 
 		 380 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1647  chorismate mutase/prephenate dehydratase  33.96 
 
 		 357 aa  42  0.002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000136907  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0121  prephenate dehydratase  38.6 
 
 		 356 aa  42.7  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1828  chorismate mutase domain-containing protein  26.14 
 
 		 103 aa  41.6  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.215612  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1769  chorismate mutase  32.1 
 
 		 367 aa  41.6  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.653886  normal  0.431896 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0361  chorismate mutase/prephenate dehydratase  33.96 
 
 		 357 aa  42  0.003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3645  chorismate mutasea  33.33 
 
 		 364 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0734175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1186  prephenate dehydratase  27.55 
 
 		 393 aa  42  0.003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.343107 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1792  chorismate mutase / prephenate dehydratase  31.08 
 
 		 360 aa  42  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027177 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6846  chorismate mutase  29.27 
 
 		 397 aa  41.6  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.235672 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0338  chorismate mutase/prephenate dehydratase  33.96 
 
 		 357 aa  41.6  0.003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3945  chorismate mutase  32.1 
 
 		 364 aa  41.6  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.117888  normal  0.0191313 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1360  chorismate mutase  32.1 
 
 		 364 aa  41.6  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0302882 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2539  chorismate mutase  34.72 
 
 		 399 aa  42  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.409768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0654  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  36.21 
 
 		 377 aa  42  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2767  chorismate mutase  37.25 
 
 		 357 aa  42  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.642402 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1297  bifunctional 3-deoxy-7-phosphoheptulonate synthase/chorismate mutase  26.19 
 
 		 363 aa  41.2  0.004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0174  chorismate mutase  29.87 
 
 		 361 aa  41.6  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2828  prephenate dehydratase / chorismate mutase  31.91 
 
 		 667 aa  41.2  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3007  chorismate mutase / prephenate dehydratase  31.91 
 
 		 667 aa  41.2  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3343  bifunctional 3-deoxy-7-phosphoheptulonate synthase/chorismate mutase  28.92 
 
 		 357 aa  41.2  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0172834  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1297  chorismate mutase  31.91 
 
 		 664 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3093  chorismate mutase  31.91 
 
 		 664 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0115511 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2913  chorismate mutase  28.26 
 
 		 648 aa  41.2  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1376  chorismate mutase  30.86 
 
 		 364 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1259  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  33.33 
 
 		 379 aa  41.2  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00675448  hitchhiker  0.000301963 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1497  P-protein (prephenate dehydratase / chorismate mutase)  34.72 
 
 		 374 aa  41.2  0.005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.554673  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>