161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1572 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_1572  holo-acyl-carrier-protein synthase  100 
 
 
131 aa  270  7e-72  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4518  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.07 
 
 
125 aa  72.8  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0376  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.97 
 
 
125 aa  69.7  0.00000000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1760  holo-acyl-carrier-protein synthase  36.13 
 
 
126 aa  64.3  0.0000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0445  holo-(acyl-carrier-protein) synthase  36.44 
 
 
119 aa  63.2  0.000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1803  4'-phosphopantetheinyl transferase  28.69 
 
 
126 aa  63.2  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.354985  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1045  holo-acyl-carrier-protein synthase  33.09 
 
 
138 aa  62.8  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.935838  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0421  4'-phosphopantetheinyl transferase  35 
 
 
139 aa  62  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.364619  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01660  Holo-(acyl-carrier-protein) synthase  27.64 
 
 
125 aa  61.6  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_387  holo-(acyl-carrier protein) synthase  36.44 
 
 
119 aa  60.5  0.000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0470  holo-acyl-carrier-protein synthase  33.07 
 
 
131 aa  60.8  0.000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0030  holo-acyl-carrier-protein synthase  30.71 
 
 
134 aa  60.5  0.000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0198  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.97 
 
 
139 aa  60.5  0.000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2970  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.42 
 
 
146 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3879  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.9 
 
 
135 aa  59.7  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.216997 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3457  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.46 
 
 
136 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.412901  normal  0.605589 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6616  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.46 
 
 
135 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.495084  normal  0.310018 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0306  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.9 
 
 
137 aa  59.3  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2230  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.18 
 
 
136 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.558509  normal  0.0780683 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2169  phosphopantethiene-protein transferase domain-contain protein  31.97 
 
 
128 aa  58.5  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000567613  hitchhiker  0.000188927 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2272  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.9 
 
 
136 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.130152 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1673  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.62 
 
 
137 aa  58.2  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1884  4'-phosphopantetheinyl transferase  27.87 
 
 
126 aa  57.8  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00133068  hitchhiker  0.0000000924869 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3023  4'-phosphopantetheinyl transferase  25.41 
 
 
125 aa  57.8  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2035  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.6 
 
 
126 aa  58.2  0.00000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0030  holo-acyl-carrier-protein synthase  31.15 
 
 
126 aa  57.8  0.00000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2547  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.9 
 
 
136 aa  57.4  0.00000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.605965  normal  0.0384272 
 
 
-
 
NC_002978  WD0814  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.81 
 
 
123 aa  57.4  0.00000007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2322  4'-phosphopantetheinyl transferase  26.23 
 
 
129 aa  57.4  0.00000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000018743  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0948  holo-acyl-carrier-protein synthase  34.62 
 
 
133 aa  57  0.00000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4685  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.59 
 
 
139 aa  57  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.1072  normal  0.886334 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2629  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.62 
 
 
158 aa  57  0.00000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.597065  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3772  holo-acyl-carrier-protein synthase  28.57 
 
 
132 aa  57  0.00000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0158338  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2573  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.33 
 
 
137 aa  56.6  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0256708 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0725  holo-acyl-carrier-protein synthase  30.08 
 
 
117 aa  56.6  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00593002  normal  0.202628 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3665  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.58 
 
 
126 aa  56.2  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1668  holo-acyl-carrier-protein synthase  29.51 
 
 
121 aa  56.6  0.0000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2527  4'-phosphopantetheinyl transferase  28.69 
 
 
126 aa  56.2  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.252162  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1920  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.15 
 
 
139 aa  55.8  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.442194 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2610  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.33 
 
 
141 aa  55.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0757866  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3631  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.33 
 
 
132 aa  55.5  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1572  holo-acyl-carrier-protein synthase  34.62 
 
 
142 aa  55.5  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.335849  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1260  4'-phosphopantetheinyl transferase  28.4 
 
 
125 aa  55.5  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.125205  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3481  holo-acyl-carrier-protein synthase  31.01 
 
 
136 aa  55.8  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.870655  normal  0.0327725 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1208  holo-acyl-carrier-protein synthase  28.8 
 
 
128 aa  56.2  0.0000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2649  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.38 
 
 
139 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.045044  normal  0.0107297 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2561  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.5 
 
 
142 aa  55.1  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0826465  hitchhiker  0.00133765 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03532  4'-phosphopantetheinyl transferase  28.1 
 
 
126 aa  55.1  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0361  holo-acyl-carrier-protein synthase  28.46 
 
 
123 aa  55.1  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0659  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.33 
 
 
134 aa  54.7  0.0000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0916337  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7365  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.62 
 
 
132 aa  55.1  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.012479  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0652  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.33 
 
 
134 aa  54.7  0.0000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.512753  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03403  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.58 
 
 
126 aa  54.7  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.109163  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0932  holo-acyl-carrier-protein synthase  33.61 
 
 
134 aa  54.3  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0422  holo-acyl-carrier-protein synthase  31.36 
 
 
119 aa  54.3  0.0000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002501  holo-[acyl-carrier protein] synthase  27.27 
 
 
126 aa  53.9  0.0000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0680  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.62 
 
 
139 aa  53.5  0.0000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1096  holo-acyl-carrier-protein synthase  31.4 
 
 
126 aa  53.5  0.0000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.383403  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1701  holo-acyl-carrier-protein synthase  29.46 
 
 
127 aa  52.8  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.092305  normal  0.0387574 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2521  4'-phosphopantetheinyl transferase  26.4 
 
 
126 aa  52.8  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.280431  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1876  holo-acyl-carrier-protein synthase  28.46 
 
 
125 aa  53.1  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3057  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.33 
 
 
130 aa  53.1  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1140  4'-phosphopantetheinyl transferase  28.93 
 
 
126 aa  52.8  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3615  4'-phosphopantetheinyl transferase  28.93 
 
 
126 aa  53.1  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1193  4'-phosphopantetheinyl transferase  28.93 
 
 
126 aa  52.8  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3067  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.75 
 
 
126 aa  52.4  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.46528  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2253  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.25 
 
 
139 aa  52.4  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.154355  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0996  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.7 
 
 
134 aa  52.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.638191  normal  0.859066 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1249  holo-acyl-carrier-protein synthase  42.86 
 
 
127 aa  52.4  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1208  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.75 
 
 
126 aa  52.8  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3236  holo-acyl-carrier-protein synthase  30.53 
 
 
140 aa  52.8  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.209642 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1149  4'-phosphopantetheinyl transferase  28.71 
 
 
134 aa  52.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1327  holo-acyl-carrier-protein synthase  32.52 
 
 
124 aa  52.4  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.122179  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1501  holo-(acyl-carrier-protein) synthase  32.8 
 
 
128 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.109211  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0250  holo-acyl-carrier-protein synthase  29.87 
 
 
123 aa  52  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2454  holo-acyl-carrier-protein synthase  31.2 
 
 
128 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0218  holo-acyl-carrier-protein synthase  30.25 
 
 
127 aa  51.6  0.000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.299586  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1406  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.34 
 
 
130 aa  51.2  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0520  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.18 
 
 
150 aa  51.6  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2638  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.71 
 
 
139 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.884369 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80966  Fatty acid synthase subunit alpha Includes: Acyl carrier 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase (Beta-ketoacyl reductase) 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase (Beta-ketoacyl synthase)  31.19 
 
 
1880 aa  50.8  0.000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.507554  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2868  holo-acyl-carrier-protein synthase  29.75 
 
 
125 aa  51.2  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0961  4'-phosphopantetheinyl transferase  25 
 
 
138 aa  51.2  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0624  4'-phosphopantetheinyl transferase  28.46 
 
 
116 aa  50.8  0.000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0738758  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0300  holo-acyl-carrier-protein synthase  27.34 
 
 
125 aa  50.8  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00231952  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2780  4'-phosphopantetheinyl transferase  28.1 
 
 
126 aa  51.2  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0278  holo-(acyl-carrier-protein) synthase  27.27 
 
 
146 aa  50.8  0.000006  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2548  holo-acyl-carrier-protein synthase  27.12 
 
 
131 aa  50.4  0.000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.351979 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0521  holo-acyl-carrier-protein synthase  30.77 
 
 
124 aa  50.4  0.000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000822969  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1384  holo-acyl-carrier-protein synthase  28.23 
 
 
130 aa  50.1  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1003  apo-(acyl-carrier-protein) pantetheinephosphotransferase  27.05 
 
 
128 aa  49.7  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00165358  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2843  4'-phosphopantetheinyl transferase  28.1 
 
 
126 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.819519 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0208  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.92 
 
 
119 aa  49.7  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0873821  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0741  4'-phosphopantetheinyl transferase  26.15 
 
 
123 aa  49.7  0.00001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.125291  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1255  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.33 
 
 
124 aa  49.7  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1283  holo-(acyl-carrier-protein) synthase  27.97 
 
 
122 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.329256 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2955  4'-phosphopantetheinyl transferase  28.1 
 
 
126 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.620212  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2820  4'-phosphopantetheinyl transferase  28.1 
 
 
126 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.539822  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2739  4'-phosphopantetheinyl transferase  28.1 
 
 
126 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.180999  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02421  hypothetical protein  27.27 
 
 
126 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>