35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_1286 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008701  Pisl_1286  hypothetical protein  100 
 
 		 385 aa  777    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0264  hypothetical protein  78.44 
 
 		 383 aa  549  1e-155  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0285  hypothetical protein  65.14 
 
 		 401 aa  505  9.999999999999999e-143  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.543411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1374  hypothetical protein  64.06 
 
 		 406 aa  457  1e-127  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.643705 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01930  Predicted permease  29.94 
 
 		 1232 aa  60.1  0.00000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.436624  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1169  chromosome segregation protein SMC  22.6 
 
 		 1177 aa  56.2  0.0000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0527  chromosome segregation protein SMC  27.17 
 
 		 1193 aa  51.6  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.534964 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  21.47 
 
 		 1185 aa  48.5  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0863  S-layer domain protein  24.31 
 
 		 694 aa  48.1  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000121904  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1770  3D domain-containing protein  23.38 
 
 		 526 aa  47.4  0.0005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.103231  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0045  hypothetical protein  34.25 
 
 		 847 aa  47  0.0006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.370915  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4187  ATPase  28.67 
 
 		 893 aa  47  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4392  BRCT domain protein  25.89 
 
 		 783 aa  46.6  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.100979 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1226  CUB protein  18.06 
 
 		 1621 aa  45.8  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.287366  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05899  Condensin subunit [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8J150]  22.73 
 
 		 1179 aa  45.8  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.566819 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1571  chromosome segregation protein SMC  21.02 
 
 		 1170 aa  45.1  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2550  hypothetical protein  25.62 
 
 		 1471 aa  45.4  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0217864 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1290  ATPase  26.78 
 
 		 865 aa  45.1  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.851585  normal  0.196036 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0823  putative chaperonin clpA/B  29.45 
 
 		 865 aa  44.3  0.003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00549001 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2940  hypothetical protein  29.23 
 
 		 648 aa  44.7  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0783557 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2160  virulence factor Mce family protein  31.01 
 
 		 334 aa  44.7  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.158873  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00600  ATPase with chaperone activity, ATP-binding subunit  29.27 
 
 		 875 aa  44.3  0.003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0140  PKD domain containing protein  15.76 
 
 		 1362 aa  44.7  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0527  hypothetical protein  23.33 
 
 		 178 aa  44.3  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0259802  normal  0.0608091 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18890  hypothetical protein  29.8 
 
 		 1092 aa  43.9  0.004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.145175  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0642  chromosome segregation protein SMC  19.78 
 
 		 1189 aa  44.3  0.004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00029691 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2347  lipopolysaccharide biosynthesis  23.08 
 
 		 426 aa  43.9  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000937745  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1337  hypothetical protein  21.97 
 
 		 335 aa  43.9  0.005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.629526 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1771  S-layer domain-containing protein  25.81 
 
 		 361 aa  43.9  0.005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.797057  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0398  chromosome segregation ATPase-like protein  22.73 
 
 		 1314 aa  43.9  0.005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3975  hypothetical protein  31.62 
 
 		 467 aa  43.5  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.671186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3238  hypothetical protein  31.62 
 
 		 467 aa  43.5  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0841  ATPase AAA-2  29.19 
 
 		 865 aa  43.5  0.007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2946  FkbM family methyltransferase  22.73 
 
 		 786 aa  43.5  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.50506  normal  0.560868 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03870  myosin heavy chain, putative  21.99 
 
 		 803 aa  43.1  0.008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>