22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_0264 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_0264  hypothetical protein  100 
 
 
383 aa  765    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1286  hypothetical protein  77.92 
 
 
385 aa  613  9.999999999999999e-175  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0285  hypothetical protein  66.16 
 
 
401 aa  522  1e-147  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.543411  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1374  hypothetical protein  65.01 
 
 
406 aa  462  1e-129  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.643705 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0863  S-layer domain protein  23.86 
 
 
694 aa  55.1  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000121904  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01930  Predicted permease  29.94 
 
 
1232 aa  52.4  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.436624  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0173  chromosome segregation protein SMC  22.44 
 
 
1172 aa  52.4  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1169  chromosome segregation protein SMC  19.21 
 
 
1177 aa  50.4  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1000  hypothetical protein  25.74 
 
 
342 aa  49.7  0.00008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0177327  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2177  protein of unknown function DUF214  28.99 
 
 
1177 aa  48.1  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_39311  predicted protein  24.66 
 
 
414 aa  46.6  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0527  chromosome segregation protein SMC  28.03 
 
 
1193 aa  45.8  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.534964 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0814  hypothetical protein  26.2 
 
 
1002 aa  46.2  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0045  hypothetical protein  34.25 
 
 
847 aa  45.1  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.370915  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03870  myosin heavy chain, putative  23.68 
 
 
803 aa  43.9  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1366  conserved hypothetical protein  22.9 
 
 
395 aa  44.3  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32380  YhgE/Pip-like protein  27.21 
 
 
695 aa  43.9  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3994  phage protein  19.88 
 
 
1660 aa  43.1  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1648  histidine kinase  31.45 
 
 
1374 aa  43.1  0.009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.102759  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0841  ATPase AAA-2  29.76 
 
 
865 aa  42.7  0.01  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0823  putative chaperonin clpA/B  31.48 
 
 
865 aa  42.7  0.01  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00549001 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0169  methyl-accepting chemotaxis domain-containing protein  45.83 
 
 
552 aa  42.7  0.01  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>