33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0285 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_0285  hypothetical protein  100 
 
 
401 aa  809    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.543411  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1286  hypothetical protein  64.63 
 
 
385 aa  505  9.999999999999999e-143  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0264  hypothetical protein  65.36 
 
 
383 aa  463  1e-129  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1374  hypothetical protein  63.12 
 
 
406 aa  459  9.999999999999999e-129  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.643705 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1000  hypothetical protein  26 
 
 
342 aa  57.4  0.0000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0177327  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1290  ATPase  31.3 
 
 
865 aa  51.2  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.851585  normal  0.196036 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2250  minor structural protein  21.74 
 
 
1341 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.069848  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4392  BRCT domain protein  25.63 
 
 
783 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.100979 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1571  chromosome segregation protein SMC  34.34 
 
 
1170 aa  48.1  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0863  S-layer domain protein  20.08 
 
 
694 aa  47.4  0.0004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000121904  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0140  PKD domain containing protein  20.69 
 
 
1362 aa  45.8  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0287  ATP-dependent chaperone ClpB  28.14 
 
 
864 aa  45.1  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01930  Predicted permease  25.78 
 
 
1232 aa  45.8  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.436624  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0527  hypothetical protein  21.37 
 
 
178 aa  45.1  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0259802  normal  0.0608091 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1091  TP901 family phage tail tape measure protein  18.67 
 
 
2066 aa  45.4  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1070  TP901 family phage tail tape measure protein  18.67 
 
 
2066 aa  45.4  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.917843  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1737  hypothetical protein  22.56 
 
 
257 aa  45.1  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.332134  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2242  conserved hypothetical protein  26.44 
 
 
395 aa  45.4  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0356  SMC domain-containing protein  27.27 
 
 
700 aa  44.7  0.003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1858  ATP-dependent chaperone ClpB  25.58 
 
 
866 aa  43.9  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.0000000217935  normal  0.0630918 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0911  ATPase  28.95 
 
 
862 aa  44.3  0.004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.629487  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2933  phage minor structural protein  17.39 
 
 
1496 aa  43.9  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0509957  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1126  capsular exopolysaccharide family  27.67 
 
 
790 aa  43.9  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0796389  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1077  ATP-dependent chaperone ClpB  27.13 
 
 
871 aa  43.9  0.005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000152857  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1226  CUB protein  19.57 
 
 
1621 aa  43.5  0.006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.287366  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0045  hypothetical protein  29.63 
 
 
847 aa  43.5  0.006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.370915  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1445  putative membrane-fusion protein  24.32 
 
 
434 aa  43.5  0.006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00910386  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1337  hypothetical protein  23.44 
 
 
335 aa  43.5  0.006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.629526 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18321  ATP-dependent Clp protease, Hsp 100, ATP-binding subunit ClpB  28.95 
 
 
863 aa  43.5  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.207261 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3002  chromosome segregation protein SMC  24.87 
 
 
1192 aa  43.1  0.008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0567  ATP-dependent chaperone ClpB  29.01 
 
 
862 aa  43.1  0.008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0522418 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0161  chromosome segregation protein SMC  24.46 
 
 
1167 aa  43.1  0.008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2946  FkbM family methyltransferase  23.57 
 
 
786 aa  43.1  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.50506  normal  0.560868 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>