34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_0771 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_0771  30S ribosomal protein S3Ae  100 
 
 
222 aa  443  1.0000000000000001e-124  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.97943  hitchhiker  0.00503486 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0850  30S ribosomal protein S3Ae  81.53 
 
 
222 aa  380  1e-104  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.529449 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1182  30S ribosomal protein S3Ae  80.29 
 
 
222 aa  358  4e-98  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1852  30S ribosomal protein S3Ae  74.09 
 
 
220 aa  345  5e-94  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.422529  normal  0.18878 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1755  30S ribosomal protein S3Ae  50.54 
 
 
221 aa  200  9.999999999999999e-51  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0653  30S ribosomal protein S3Ae  51.1 
 
 
207 aa  192  3e-48  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00442858  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1802  ribosomal protein S3Ae  44.32 
 
 
208 aa  169  4e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.29613  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0067  30S ribosomal protein S3Ae  41.08 
 
 
216 aa  160  1e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0988671  normal  0.0101503 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2336  30S ribosomal protein S3Ae  38.5 
 
 
235 aa  151  8e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000133814  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1512  30S ribosomal protein S3Ae  37.57 
 
 
203 aa  140  9.999999999999999e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00595685 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0079  30S ribosomal protein S3Ae  39.01 
 
 
211 aa  138  7.999999999999999e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2127  30S ribosomal protein S3Ae  37.36 
 
 
207 aa  137  1e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.521245 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2405  ribosomal protein S3Ae  37.26 
 
 
213 aa  135  5e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.156136  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0757  30S ribosomal protein S3Ae  34.78 
 
 
229 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2131  ribosomal protein S3Ae  38.55 
 
 
206 aa  132  3e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.200453 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0722  30S ribosomal protein S3Ae  39.53 
 
 
206 aa  132  6e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1522  30S ribosomal protein S3Ae  33.15 
 
 
220 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.669126  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2508  30S ribosomal protein S3Ae  34.74 
 
 
198 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.662669 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1695  30S ribosomal protein S3Ae  34.78 
 
 
224 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1398  ribosomal protein S3Ae  37.24 
 
 
212 aa  129  3e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0217  30S ribosomal protein S3Ae  34.78 
 
 
225 aa  129  3e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0633  ribosomal protein S3Ae  38.04 
 
 
241 aa  129  4.0000000000000003e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0905  30S ribosomal protein S3Ae  34.78 
 
 
225 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0427  30S ribosomal protein S3Ae  34.83 
 
 
197 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.872315  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0618  30S ribosomal protein S3Ae  37.89 
 
 
215 aa  122  3e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0281131  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2238  30S ribosomal protein S3Ae  36.67 
 
 
201 aa  121  8e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0287  30S ribosomal protein S3Ae  31.69 
 
 
206 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2657  30S ribosomal protein S3Ae  30.56 
 
 
198 aa  103  3e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0850453  normal  0.810485 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08870  40S ribosomal protein S3Ae (AFU_orthologue; AFUA_5G05450)  30.91 
 
 
256 aa  98.6  6e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00214478  hitchhiker  7.2997e-16 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_28528  Ribosomal protein S3a, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  28.5 
 
 
260 aa  98.6  6e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.162919  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90304  predicted protein  30.5 
 
 
256 aa  95.9  4e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.156537  normal  0.643856 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04880  40s ribosomal protein s3ae-a (s1-a), putative  29 
 
 
259 aa  94  2e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46030  40S ribosomal protein S3aE (S1)  32.18 
 
 
256 aa  94  2e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.517791  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17545  predicted protein  28.18 
 
 
261 aa  93.2  3e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>