34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_28528 on replicon NC_009373
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009373  OSTLU_28528  Ribosomal protein S3a, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  100 
 
 
260 aa  532  1e-150  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.162919  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08870  40S ribosomal protein S3Ae (AFU_orthologue; AFUA_5G05450)  63.14 
 
 
256 aa  339  2e-92  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00214478  hitchhiker  7.2997e-16 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04880  40s ribosomal protein s3ae-a (s1-a), putative  67.07 
 
 
259 aa  339  2.9999999999999998e-92  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90304  predicted protein  63.52 
 
 
256 aa  318  7.999999999999999e-86  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.156537  normal  0.643856 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46030  40S ribosomal protein S3aE (S1)  61.89 
 
 
256 aa  311  7.999999999999999e-84  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.517791  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17545  predicted protein  57.94 
 
 
261 aa  290  1e-77  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0079  30S ribosomal protein S3Ae  34.36 
 
 
211 aa  112  7.000000000000001e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2336  30S ribosomal protein S3Ae  31.67 
 
 
235 aa  109  5e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000133814  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1695  30S ribosomal protein S3Ae  32.11 
 
 
224 aa  106  4e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1522  30S ribosomal protein S3Ae  31.17 
 
 
220 aa  104  2e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.669126  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2127  30S ribosomal protein S3Ae  32.18 
 
 
207 aa  102  5e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.521245 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0217  30S ribosomal protein S3Ae  33.02 
 
 
225 aa  101  1e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0771  30S ribosomal protein S3Ae  27.73 
 
 
222 aa  99.8  5e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.97943  hitchhiker  0.00503486 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0905  30S ribosomal protein S3Ae  32.08 
 
 
225 aa  99.4  6e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0850  30S ribosomal protein S3Ae  27.27 
 
 
222 aa  99  7e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.529449 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0757  30S ribosomal protein S3Ae  31.31 
 
 
229 aa  97.8  2e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1182  30S ribosomal protein S3Ae  26 
 
 
222 aa  95.1  9e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2405  ribosomal protein S3Ae  28.93 
 
 
213 aa  90.9  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.156136  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2131  ribosomal protein S3Ae  27.04 
 
 
206 aa  90.5  3e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.200453 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1398  ribosomal protein S3Ae  28.65 
 
 
212 aa  90.5  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1852  30S ribosomal protein S3Ae  25.91 
 
 
220 aa  90.1  3e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.422529  normal  0.18878 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0067  30S ribosomal protein S3Ae  30.99 
 
 
216 aa  87.4  2e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0988671  normal  0.0101503 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0653  30S ribosomal protein S3Ae  27.94 
 
 
207 aa  87.8  2e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00442858  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1802  ribosomal protein S3Ae  29.46 
 
 
208 aa  85.9  6e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.29613  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2238  30S ribosomal protein S3Ae  28.84 
 
 
201 aa  84  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0722  30S ribosomal protein S3Ae  27.6 
 
 
206 aa  84.3  0.000000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0633  ribosomal protein S3Ae  30.5 
 
 
241 aa  83.6  0.000000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2508  30S ribosomal protein S3Ae  30.81 
 
 
198 aa  80.1  0.00000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.662669 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0427  30S ribosomal protein S3Ae  25.84 
 
 
197 aa  80.1  0.00000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.872315  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0618  30S ribosomal protein S3Ae  27.04 
 
 
215 aa  78.2  0.0000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0281131  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0287  30S ribosomal protein S3Ae  25.23 
 
 
206 aa  77  0.0000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2657  30S ribosomal protein S3Ae  26.76 
 
 
198 aa  73.9  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0850453  normal  0.810485 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1512  30S ribosomal protein S3Ae  24.62 
 
 
203 aa  70.5  0.00000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00595685 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1755  30S ribosomal protein S3Ae  27.04 
 
 
221 aa  64.7  0.000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>