34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1182 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1182  30S ribosomal protein S3Ae  100 
 
 		 222 aa  442  1e-123  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0850  30S ribosomal protein S3Ae  80.63 
 
 		 222 aa  376  1e-103  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.529449 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0771  30S ribosomal protein S3Ae  77.93 
 
 		 222 aa  369  1e-101  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.97943  hitchhiker  0.00503486 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1852  30S ribosomal protein S3Ae  77.27 
 
 		 220 aa  355  3.9999999999999996e-97  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.422529  normal  0.18878 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1755  30S ribosomal protein S3Ae  48.02 
 
 		 221 aa  199  1.9999999999999998e-50  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0653  30S ribosomal protein S3Ae  49.23 
 
 		 207 aa  186  3e-46  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00442858  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1802  ribosomal protein S3Ae  48.65 
 
 		 208 aa  172  2.9999999999999996e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.29613  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0067  30S ribosomal protein S3Ae  43.78 
 
 		 216 aa  164  1.0000000000000001e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0988671  normal  0.0101503 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2336  30S ribosomal protein S3Ae  39.02 
 
 		 235 aa  149  2e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000133814  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1512  30S ribosomal protein S3Ae  40.21 
 
 		 203 aa  144  9e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00595685 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0757  30S ribosomal protein S3Ae  36.41 
 
 		 229 aa  139  3e-32  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2127  30S ribosomal protein S3Ae  38.46 
 
 		 207 aa  135  7.000000000000001e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.521245 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0427  30S ribosomal protein S3Ae  37.64 
 
 		 197 aa  131  6.999999999999999e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.872315  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0079  30S ribosomal protein S3Ae  38.46 
 
 		 211 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1695  30S ribosomal protein S3Ae  35 
 
 		 224 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0217  30S ribosomal protein S3Ae  34.78 
 
 		 225 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2131  ribosomal protein S3Ae  37.43 
 
 		 206 aa  129  5.0000000000000004e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.200453 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2405  ribosomal protein S3Ae  36.55 
 
 		 213 aa  127  1.0000000000000001e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.156136  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0905  30S ribosomal protein S3Ae  34.78 
 
 		 225 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1522  30S ribosomal protein S3Ae  34.5 
 
 		 220 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.669126  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2508  30S ribosomal protein S3Ae  36.11 
 
 		 198 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.662669 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1398  ribosomal protein S3Ae  37.21 
 
 		 212 aa  124  1e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0722  30S ribosomal protein S3Ae  36.63 
 
 		 206 aa  123  2e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0633  ribosomal protein S3Ae  38.59 
 
 		 241 aa  122  4e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2238  30S ribosomal protein S3Ae  35.79 
 
 		 201 aa  118  6e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0618  30S ribosomal protein S3Ae  37.88 
 
 		 215 aa  118  7.999999999999999e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0281131  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2657  30S ribosomal protein S3Ae  35 
 
 		 198 aa  108  5e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0850453  normal  0.810485 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0287  30S ribosomal protein S3Ae  28.89 
 
 		 206 aa  101  1e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_28528  Ribosomal protein S3a, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  26 
 
 		 260 aa  95.5  6e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.162919  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04880  40s ribosomal protein s3ae-a (s1-a), putative  26.5 
 
 		 259 aa  90.9  1e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08870  40S ribosomal protein S3Ae (AFU_orthologue; AFUA_5G05450)  28.71 
 
 		 256 aa  87.4  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00214478  hitchhiker  7.2997e-16 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90304  predicted protein  27 
 
 		 256 aa  87.4  1e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.156537  normal  0.643856 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17545  predicted protein  26.5 
 
 		 261 aa  86.7  2e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46030  40S ribosomal protein S3aE (S1)  28.71 
 
 		 256 aa  84  0.000000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.517791  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>