34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNB04880 on replicon NC_006684
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006684  CNB04880  40s ribosomal protein s3ae-a (s1-a), putative  100 
 
 		 259 aa  529  1e-149  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08870  40S ribosomal protein S3Ae (AFU_orthologue; AFUA_5G05450)  66.02 
 
 		 256 aa  359  3e-98  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00214478  hitchhiker  7.2997e-16 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_28528  Ribosomal protein S3a, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  67.48 
 
 		 260 aa  339  2.9999999999999998e-92  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.162919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90304  predicted protein  67.21 
 
 		 256 aa  332  4e-90  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.156537  normal  0.643856 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46030  40S ribosomal protein S3aE (S1)  63.93 
 
 		 256 aa  320  9.999999999999999e-87  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.517791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17545  predicted protein  53.88 
 
 		 261 aa  276  3e-73  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2127  30S ribosomal protein S3Ae  33.65 
 
 		 207 aa  120  3e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.521245 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0079  30S ribosomal protein S3Ae  35.38 
 
 		 211 aa  117  3e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2336  30S ribosomal protein S3Ae  32.56 
 
 		 235 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000133814  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2405  ribosomal protein S3Ae  31.12 
 
 		 213 aa  100  2e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.156136  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1398  ribosomal protein S3Ae  32.46 
 
 		 212 aa  100  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0850  30S ribosomal protein S3Ae  30 
 
 		 222 aa  99.4  6e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.529449 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1522  30S ribosomal protein S3Ae  30.51 
 
 		 220 aa  99  6e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.669126  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1695  30S ribosomal protein S3Ae  31.3 
 
 		 224 aa  98.2  1e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2131  ribosomal protein S3Ae  29.74 
 
 		 206 aa  96.7  3e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.200453 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0722  30S ribosomal protein S3Ae  31.41 
 
 		 206 aa  96.7  3e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0217  30S ribosomal protein S3Ae  31.8 
 
 		 225 aa  96.3  5e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0757  30S ribosomal protein S3Ae  31.75 
 
 		 229 aa  95.9  5e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0905  30S ribosomal protein S3Ae  31.34 
 
 		 225 aa  95.1  9e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0771  30S ribosomal protein S3Ae  28.18 
 
 		 222 aa  94.4  2e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.97943  hitchhiker  0.00503486 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1182  30S ribosomal protein S3Ae  26.5 
 
 		 222 aa  90.9  2e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0618  30S ribosomal protein S3Ae  28.12 
 
 		 215 aa  89.7  4e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0281131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0653  30S ribosomal protein S3Ae  31.68 
 
 		 207 aa  87.8  2e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00442858  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1802  ribosomal protein S3Ae  29.38 
 
 		 208 aa  87.4  2e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.29613  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2657  30S ribosomal protein S3Ae  29.95 
 
 		 198 aa  86.3  4e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0850453  normal  0.810485 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0067  30S ribosomal protein S3Ae  27.7 
 
 		 216 aa  84.3  0.000000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0988671  normal  0.0101503 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0427  30S ribosomal protein S3Ae  26.7 
 
 		 197 aa  82.8  0.000000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.872315  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2238  30S ribosomal protein S3Ae  28.28 
 
 		 201 aa  81.6  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1852  30S ribosomal protein S3Ae  26.82 
 
 		 220 aa  81.3  0.00000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.422529  normal  0.18878 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1512  30S ribosomal protein S3Ae  27.8 
 
 		 203 aa  79.3  0.00000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00595685 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0633  ribosomal protein S3Ae  29.7 
 
 		 241 aa  77.8  0.0000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2508  30S ribosomal protein S3Ae  28.71 
 
 		 198 aa  75.9  0.0000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.662669 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0287  30S ribosomal protein S3Ae  26.36 
 
 		 206 aa  73.9  0.000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1755  30S ribosomal protein S3Ae  28.57 
 
 		 221 aa  72.4  0.000000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>