34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0427 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0427  30S ribosomal protein S3Ae  100 
 
 		 197 aa  401  1e-111  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.872315  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2238  30S ribosomal protein S3Ae  62.76 
 
 		 201 aa  261  6e-69  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2657  30S ribosomal protein S3Ae  57.81 
 
 		 198 aa  249  2e-65  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0850453  normal  0.810485 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2508  30S ribosomal protein S3Ae  51.56 
 
 		 198 aa  228  5e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.662669 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0287  30S ribosomal protein S3Ae  47.94 
 
 		 206 aa  201  5e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2336  30S ribosomal protein S3Ae  44.56 
 
 		 235 aa  189  2e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000133814  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0079  30S ribosomal protein S3Ae  44.5 
 
 		 211 aa  188  4e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2127  30S ribosomal protein S3Ae  43.46 
 
 		 207 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.521245 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1802  ribosomal protein S3Ae  40.33 
 
 		 208 aa  156  2e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.29613  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0618  30S ribosomal protein S3Ae  42.61 
 
 		 215 aa  156  2e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0281131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2131  ribosomal protein S3Ae  39.89 
 
 		 206 aa  152  2e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.200453 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0722  30S ribosomal protein S3Ae  38.42 
 
 		 206 aa  152  2e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1398  ribosomal protein S3Ae  40.11 
 
 		 212 aa  151  5e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2405  ribosomal protein S3Ae  40.45 
 
 		 213 aa  150  8e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.156136  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0633  ribosomal protein S3Ae  43.33 
 
 		 241 aa  145  5e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0757  30S ribosomal protein S3Ae  36.32 
 
 		 229 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0067  30S ribosomal protein S3Ae  34.27 
 
 		 216 aa  135  3.0000000000000003e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0988671  normal  0.0101503 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1522  30S ribosomal protein S3Ae  36.56 
 
 		 220 aa  135  5e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.669126  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1695  30S ribosomal protein S3Ae  35.94 
 
 		 224 aa  135  5e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1755  30S ribosomal protein S3Ae  38.12 
 
 		 221 aa  135  5e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0217  30S ribosomal protein S3Ae  36.56 
 
 		 225 aa  134  7.000000000000001e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0905  30S ribosomal protein S3Ae  36.02 
 
 		 225 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0653  30S ribosomal protein S3Ae  38.33 
 
 		 207 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00442858  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1182  30S ribosomal protein S3Ae  37.64 
 
 		 222 aa  131  6e-30  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0850  30S ribosomal protein S3Ae  35.39 
 
 		 222 aa  130  9e-30  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.529449 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0771  30S ribosomal protein S3Ae  34.83 
 
 		 222 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.97943  hitchhiker  0.00503486 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1852  30S ribosomal protein S3Ae  33.71 
 
 		 220 aa  121  8e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.422529  normal  0.18878 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1512  30S ribosomal protein S3Ae  33.67 
 
 		 203 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00595685 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04880  40s ribosomal protein s3ae-a (s1-a), putative  26.7 
 
 		 259 aa  82.4  0.000000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08870  40S ribosomal protein S3Ae (AFU_orthologue; AFUA_5G05450)  25.63 
 
 		 256 aa  78.6  0.00000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00214478  hitchhiker  7.2997e-16 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_28528  Ribosomal protein S3a, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  25.89 
 
 		 260 aa  77.8  0.00000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.162919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17545  predicted protein  23.3 
 
 		 261 aa  72  0.000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90304  predicted protein  24.61 
 
 		 256 aa  69.3  0.00000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.156537  normal  0.643856 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46030  40S ribosomal protein S3aE (S1)  25.91 
 
 		 256 aa  67  0.0000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.517791  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>