More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2239 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2239  esterase/lipase/thioesterase  100 
 
 
322 aa  647    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4781  hypothetical protein  66.13 
 
 
337 aa  431  1e-119  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.168698  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4330  hypothetical protein  67.24 
 
 
297 aa  413  1e-114  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3153  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.5 
 
 
316 aa  144  2e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.566482  normal  0.453158 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3477  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  36.95 
 
 
316 aa  143  4e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.306055  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0540  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.8 
 
 
318 aa  143  4e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.846843 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5823  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  29.93 
 
 
320 aa  142  8e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0472  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.86 
 
 
322 aa  142  8e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3349  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.35 
 
 
316 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.399872  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6392  hypothetical protein  39.09 
 
 
220 aa  138  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3261  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.23 
 
 
316 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.194247 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1452  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.02 
 
 
318 aa  132  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4532  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  36.84 
 
 
316 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.472069  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2712  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  44.93 
 
 
229 aa  99.4  8e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.149419  normal  0.0838365 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3154  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  29.76 
 
 
292 aa  99  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11428  lipase lipH  33.83 
 
 
319 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.13371e-22  normal  0.199346 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06580  esterase/lipase  34.16 
 
 
316 aa  97.8  2e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.397736  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1186  Alpha/beta hydrolase fold-3  29.64 
 
 
311 aa  97.8  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.102278  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4942  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  31.84 
 
 
314 aa  96.7  5e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1549  Alpha/beta hydrolase fold-3  34.74 
 
 
315 aa  94.7  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.149777  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1347  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  31.05 
 
 
299 aa  93.2  5e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00373411 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1370  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  33.19 
 
 
347 aa  92.4  9e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2875  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  33.61 
 
 
310 aa  90.5  4e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.406722  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1217  esterase/lipase/thioesterase  31.18 
 
 
312 aa  89.4  8e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.265662  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0439  putative lipase/esterase protein  32.48 
 
 
317 aa  88.6  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.681121 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0890  putative lipase  30.43 
 
 
310 aa  88.6  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.120136  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1487  putative lipase/esterase  33.18 
 
 
305 aa  88.6  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0809512  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1475  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  34.18 
 
 
347 aa  88.6  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.298032  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1307  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  30.39 
 
 
313 aa  88.2  2e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0504826 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1670  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.68 
 
 
309 aa  88.2  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2623  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  31.88 
 
 
325 aa  88.2  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.04826  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3180  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  32.31 
 
 
324 aa  87  4e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.407678  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0370  lipolytic protein  35.47 
 
 
305 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2733  carboxylesterase  28.45 
 
 
318 aa  86.3  6e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.0800200000000004e-18 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6777  lipolytic protein  32.38 
 
 
316 aa  86.3  7e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1266  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  33.06 
 
 
628 aa  85.9  8e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.19561  hitchhiker  0.00155525 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2464  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  34.04 
 
 
317 aa  85.9  9e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000166142  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1213  lipolytic protein  32.09 
 
 
309 aa  85.9  9e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.583626  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2458  Alpha/beta hydrolase fold-3  28.23 
 
 
483 aa  85.9  9e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.81737 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2218  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  29.64 
 
 
382 aa  85.9  9e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000644131  normal  0.0211816 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0126  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  29.71 
 
 
312 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.586545  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0604  esterase/lipase-like protein  28.19 
 
 
346 aa  85.1  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000548029 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2556  carboxylesterase  27.92 
 
 
318 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000242453 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3735  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.46 
 
 
310 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0759445 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3867  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.47 
 
 
310 aa  85.1  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.695714  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0324  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  28.57 
 
 
308 aa  84  0.000000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2672  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.31 
 
 
309 aa  84.3  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.795558  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3462  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  27.68 
 
 
329 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.477584 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6232  esterase/lipase/thioesterase  32.74 
 
 
329 aa  83.2  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1441  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  29.08 
 
 
317 aa  83.2  0.000000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3286  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  29.33 
 
 
329 aa  82.8  0.000000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0952  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  28.63 
 
 
318 aa  82.4  0.000000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0870  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.65 
 
 
310 aa  82.4  0.000000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.53129  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0983  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  31.54 
 
 
309 aa  82.4  0.000000000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.875721 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2028  Alpha/beta hydrolase fold-3  32.08 
 
 
310 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37370  putative esterase  33.96 
 
 
309 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000409055  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2074  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.08 
 
 
310 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4562  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.13 
 
 
314 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0210924  normal  0.223571 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3653  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  29.49 
 
 
308 aa  81.6  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2306  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  30.89 
 
 
307 aa  80.9  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2011  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.08 
 
 
310 aa  80.9  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.706628  normal  0.382275 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1835  acetyl esterase  26.33 
 
 
331 aa  80.9  0.00000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3606  putative esterase/lipase  29.53 
 
 
317 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0140226  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3222  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  28.98 
 
 
316 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.29245  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3113  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  29.35 
 
 
337 aa  79.7  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.723098  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2159  hypothetical protein  30.13 
 
 
444 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4178  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  29.3 
 
 
311 aa  79.7  0.00000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.484378  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0305  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  31.78 
 
 
310 aa  79.7  0.00000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0652  putative acetyl-hydrolase  34.42 
 
 
321 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0661  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  26.79 
 
 
329 aa  79.3  0.00000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.372291 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3484  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.18 
 
 
289 aa  79.7  0.00000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2303  putative esterase  34.42 
 
 
315 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.68218  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0171  esterase, putative  34.42 
 
 
321 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3543  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  29.05 
 
 
315 aa  79.3  0.00000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.560296  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2776  putative esterase  34.42 
 
 
315 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0827  esterase, putative  34.42 
 
 
321 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4064  putative lipase/esterase  29.81 
 
 
318 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.402424  normal  0.850299 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2383  putative acetyl-hydrolase  34.42 
 
 
315 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0668  putative acetyl-hydrolase  34.42 
 
 
321 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2872  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.33 
 
 
325 aa  79.3  0.00000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0282555  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3541  hypothetical protein  28.28 
 
 
310 aa  79  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3668  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  28.23 
 
 
317 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3028  esterase/lipase/thioesterase  28.94 
 
 
314 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0380453  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0567  acetyl esterase  26.89 
 
 
319 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3541  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  27.36 
 
 
301 aa  78.6  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1001  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  28.04 
 
 
311 aa  78.2  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2512  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  28.77 
 
 
317 aa  77.8  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.119667  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5462  esterase/lipase/thioesterase  32.31 
 
 
311 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.536989  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3787  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  28.04 
 
 
322 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4884  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  30.7 
 
 
289 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4691  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  30.81 
 
 
314 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.123094  normal  0.0800225 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4456  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  31.96 
 
 
318 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.477354  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2072  putative fusion protein  30.56 
 
 
884 aa  78.2  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.987766  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3134  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  26.47 
 
 
319 aa  77.4  0.0000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.999028  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0519  acetyl esterase  26.47 
 
 
319 aa  77.4  0.0000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.264659  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0314  Alpha/beta hydrolase fold-3  31.31 
 
 
310 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0217857  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2797  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  31.75 
 
 
320 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3140  acetyl esterase  26.05 
 
 
319 aa  77.4  0.0000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.848607  hitchhiker  0.00168444 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0324  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  31.31 
 
 
310 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.381561  normal  0.441011 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3664  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  28.16 
 
 
313 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>