More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_6392 on replicon NC_009622
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009622  Smed_6392  hypothetical protein  100 
 
 		 220 aa  449  1e-125  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5823  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  45.09 
 
 		 320 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2239  esterase/lipase/thioesterase  39.09 
 
 		 322 aa  138  7.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4330  hypothetical protein  35.59 
 
 		 297 aa  122  6e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4781  hypothetical protein  36.42 
 
 		 337 aa  121  8e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.168698  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0472  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.05 
 
 		 322 aa  103  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1452  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.94 
 
 		 318 aa  92  7e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3349  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  35.8 
 
 		 316 aa  90.9  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.399872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3261  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  31.42 
 
 		 316 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.194247 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3153  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.03 
 
 		 316 aa  89  6e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.566482  normal  0.453158 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3477  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  35.03 
 
 		 316 aa  88.6  7e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.306055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2712  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.22 
 
 		 229 aa  86.3  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.149419  normal  0.0838365 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3028  esterase/lipase/thioesterase  37.69 
 
 		 314 aa  83.2  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0380453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2420  Alpha/beta hydrolase fold-3  36.24 
 
 		 314 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.40186  normal  0.0240914 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0540  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.13 
 
 		 318 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.846843 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4532  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  33.49 
 
 		 316 aa  75.9  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.472069  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0890  putative lipase  31.02 
 
 		 310 aa  75.1  0.0000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.120136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6232  esterase/lipase/thioesterase  31.76 
 
 		 329 aa  74.3  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2875  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  32.05 
 
 		 310 aa  74.3  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.406722  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4942  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  30.16 
 
 		 314 aa  72  0.000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3757  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  30.99 
 
 		 311 aa  71.6  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.315687 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3134  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  31.47 
 
 		 319 aa  68.9  0.00000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.999028  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3140  acetyl esterase  30.77 
 
 		 319 aa  68.9  0.00000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.848607  hitchhiker  0.00168444 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0519  acetyl esterase  31.47 
 
 		 319 aa  68.9  0.00000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.264659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0942  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  31.97 
 
 		 312 aa  68.6  0.00000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.911706  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00427  acetyl esterase  30.77 
 
 		 319 aa  68.6  0.00000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0553  acetyl esterase  30.77 
 
 		 319 aa  68.6  0.00000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00432  hypothetical protein  30.77 
 
 		 319 aa  68.6  0.00000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0407  acetyl esterase  30.77 
 
 		 319 aa  68.2  0.00000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3154  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.58 
 
 		 292 aa  67.8  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0758  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  32.21 
 
 		 376 aa  67.8  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0959861 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0567  acetyl esterase  31.47 
 
 		 319 aa  67.8  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0324  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  32.45 
 
 		 308 aa  67.4  0.0000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0514  acetyl esterase  30.07 
 
 		 319 aa  67  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.198831  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4223  putative lipase/esterase  34.62 
 
 		 320 aa  64.3  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2443  putative lipase  32.39 
 
 		 292 aa  63.5  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12985  lipase/esterase lipN  30.89 
 
 		 376 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4466  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32 
 
 		 320 aa  63.2  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0674396 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6775  esterase/lipase/thioesterase  30.2 
 
 		 327 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.641311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_35358  putative esterase  25.52 
 
 		 358 aa  62.4  0.000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0155  esterase / lipase  32.37 
 
 		 318 aa  62  0.000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3113  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  33.33 
 
 		 337 aa  61.2  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.723098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5462  esterase/lipase/thioesterase  31.72 
 
 		 311 aa  61.2  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.536989  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1475  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  31.01 
 
 		 326 aa  61.2  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.617097  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1186  Alpha/beta hydrolase fold-3  29.53 
 
 		 311 aa  61.6  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.102278  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1039  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  30.52 
 
 		 319 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.240306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4884  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.55 
 
 		 289 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1935  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  32.23 
 
 		 319 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0879113  normal  0.508771 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2267  putative esterase/lipase  28.93 
 
 		 321 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.170928 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2703  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  33.85 
 
 		 316 aa  60.1  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00278676  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1441  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  32.61 
 
 		 317 aa  59.7  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1307  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  29.17 
 
 		 313 aa  59.7  0.00000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0504826 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2844  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  32.84 
 
 		 337 aa  59.7  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.446939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0952  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  29.95 
 
 		 318 aa  59.7  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2218  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  34.78 
 
 		 382 aa  59.7  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000644131  normal  0.0211816 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1072  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  29.05 
 
 		 301 aa  59.3  0.00000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1213  lipolytic protein  27.81 
 
 		 309 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.583626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2782  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  31.25 
 
 		 320 aa  59.3  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0373  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  27.34 
 
 		 339 aa  59.3  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00172019  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2599  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  34.29 
 
 		 370 aa  58.5  0.00000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3098  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  29.69 
 
 		 338 aa  58.5  0.00000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.387961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3121  esterase/lipase/thioesterase  35.56 
 
 		 321 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2140  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.39 
 
 		 306 aa  58.2  0.00000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1585  dienelactone hydrolase  34.46 
 
 		 323 aa  58.2  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.144212  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2072  putative fusion protein  30.82 
 
 		 884 aa  58.2  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.987766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1839  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  27.81 
 
 		 311 aa  57.8  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.166294  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36320  esterase/lipase  34.96 
 
 		 353 aa  57  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1194  carboxylesterase Est2  29.56 
 
 		 321 aa  57  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.5931  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1430  esterase  29.56 
 
 		 319 aa  57  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.482815  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1921  carboxylesterase Est2  29.56 
 
 		 321 aa  57  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2448  esterase  32.77 
 
 		 352 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.376855  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3383  esterase  29.56 
 
 		 319 aa  57  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.418724  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0839  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  28.26 
 
 		 339 aa  57.4  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1843  Alpha/beta hydrolase fold-3  27.69 
 
 		 344 aa  57.4  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0838402  normal  0.122403 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1670  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  28.67 
 
 		 309 aa  57  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2286  carboxylesterase Est2  29.56 
 
 		 319 aa  57  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.124272  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0983  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  29.81 
 
 		 309 aa  57  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.875721 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1434  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  29.92 
 
 		 326 aa  57  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0842646 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2325  carboxylesterase Est2  29.56 
 
 		 321 aa  57  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.152899  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2737  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  33.33 
 
 		 343 aa  57.4  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.163672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5601  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  30.25 
 
 		 342 aa  57  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1266  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.32 
 
 		 628 aa  57.4  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.19561  hitchhiker  0.00155525 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0403  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  28.8 
 
 		 336 aa  57  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1001  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  35.51 
 
 		 311 aa  56.6  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6313  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  28.57 
 
 		 311 aa  56.6  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.179325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1799  putative esterase/lipase  28.67 
 
 		 320 aa  56.6  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1447  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  31.75 
 
 		 308 aa  56.6  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.47859 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2623  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  31.76 
 
 		 325 aa  56.2  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.04826  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA05120  conserved hypothetical protein  29.6 
 
 		 322 aa  55.8  0.0000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1772  esterase/lipase protein  30.71 
 
 		 344 aa  55.8  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2149  esterase  32.03 
 
 		 327 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.571697  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3653  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.26 
 
 		 308 aa  55.5  0.0000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6777  lipolytic protein  32.41 
 
 		 316 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2525  Alpha/beta hydrolase fold-3  28.67 
 
 		 320 aa  55.1  0.0000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.253728  hitchhiker  0.0086518 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1549  Alpha/beta hydrolase fold-3  38.04 
 
 		 315 aa  55.1  0.0000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.149777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11428  lipase lipH  29.93 
 
 		 319 aa  55.1  0.0000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.13371e-22  normal  0.199346 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4562  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  31.54 
 
 		 314 aa  55.1  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0210924  normal  0.223571 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2162  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.79 
 
 		 371 aa  55.1  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1807  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.33 
 
 		 319 aa  54.7  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.086728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0698  lipolytic protein  32.23 
 
 		 343 aa  54.7  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0505791  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>