51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_1217 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_1217  hypothetical protein  100 
 
 		 161 aa  334  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1417  water stress/hypersensitive response protein  50.91 
 
 		 165 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00876316  normal  0.917345 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50940  hypothetical protein  51.88 
 
 		 164 aa  163  8e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.30636  hitchhiker  0.0000172849 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4345  hypothetical protein  53.85 
 
 		 151 aa  157  5e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1139  water stress/hypersensitive response domain-containing protein  50.7 
 
 		 158 aa  147  5e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.398344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4298  water stress/hypersensitive response domain-containing protein  49.65 
 
 		 158 aa  143  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.541122  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4130  hypothetical protein  43.31 
 
 		 164 aa  141  4e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3866  hypothetical protein  42.04 
 
 		 163 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.10342  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1115  putative lipoprotein  48.23 
 
 		 167 aa  137  7e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00366375 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1154  water stress/hypersensitive response protein  48.23 
 
 		 167 aa  136  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19360  hypothetical protein  45.93 
 
 		 136 aa  129  1.0000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.865107  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25340  hypothetical protein  39.33 
 
 		 167 aa  115  3e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0609  hypothetical protein  31.3 
 
 		 159 aa  70.9  0.000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.647076  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0942  putative lipoprotein  25.66 
 
 		 160 aa  69.7  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.236049  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1587  Water Stress and Hypersensitive response domain protein  29.13 
 
 		 158 aa  68.2  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.205042  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3789  putative lipoprotein  25.19 
 
 		 167 aa  64.7  0.0000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0799  Water Stress and Hypersensitive response domain protein  27.91 
 
 		 167 aa  61.2  0.000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.335821  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0650  hypothetical protein  27.91 
 
 		 167 aa  61.2  0.000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3032  putative lipoprotein  27.68 
 
 		 159 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0397077 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1928  Water Stress and Hypersensitive response domain protein  26.81 
 
 		 167 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.198508  normal  0.554929 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3319  Late embryogenesis abundant protein 2  27.56 
 
 		 165 aa  56.6  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000162689  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1708  hypothetical protein  29.91 
 
 		 193 aa  56.2  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3165  lipoprotein, putative  25.89 
 
 		 159 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.262178  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2421  hypothetical protein  25.4 
 
 		 158 aa  54.7  0.0000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2272  putative lipoprotein  28.15 
 
 		 167 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000762605  normal  0.468877 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1033  water stress/hypersensitive response domain-containing protein  27.64 
 
 		 163 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.357786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1774  water stress/hypersensitive response protein  24.83 
 
 		 161 aa  53.1  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.676059 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2902  water stress/hypersensitive response domain-containing protein  26.43 
 
 		 180 aa  52.4  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.586012  normal  0.820452 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0927  Late embryogenesis abundant protein 2  25.98 
 
 		 165 aa  53.1  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5672e-31 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3546  water stress/hypersensitive response protein  24.82 
 
 		 159 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0203  putative lipoprotein  25 
 
 		 166 aa  51.6  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413636  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1729  putative lipoprotein  26.02 
 
 		 167 aa  51.2  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3163  putative lipoprotein  26.02 
 
 		 167 aa  51.2  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3634  putative lipoprotein  26.02 
 
 		 167 aa  51.2  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3609  putative lipoprotein  26.02 
 
 		 167 aa  51.2  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0037  putative lipoprotein  26.02 
 
 		 167 aa  51.2  0.000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2815  hypothetical protein  26.02 
 
 		 180 aa  51.2  0.000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3621  putative lipoprotein  26.02 
 
 		 167 aa  51.2  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.329911  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3440  Water Stress and Hypersensitive response domain protein  26.35 
 
 		 155 aa  50.4  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.983784  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1086  water stress/hypersensitive response protein  27.35 
 
 		 157 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.605963 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3583  hypothetical protein  26.43 
 
 		 183 aa  50.4  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.732027 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2944  hypothetical protein  25.95 
 
 		 198 aa  50.4  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01550  putative lipoprotein  24.19 
 
 		 166 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.814803  normal  0.550997 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2611  hypothetical protein  23.77 
 
 		 164 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.476035  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3726  hypothetical protein  25.76 
 
 		 196 aa  49.7  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0494  hypothetical protein  23.77 
 
 		 164 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.655749  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0467  water stress/hypersensitive response domain-containing protein  24.79 
 
 		 164 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.353267 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0399  hypothetical protein  24.81 
 
 		 164 aa  48.9  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0426  water stress/hypersensitive response domain-containing protein  25.78 
 
 		 164 aa  47  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.63413 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1164  water stress/hypersensitive response protein  24.53 
 
 		 168 aa  44.7  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0149  putative lipoprotein  25.2 
 
 		 160 aa  43.1  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.400959  normal  0.856742 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>