55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_0203 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0203  putative lipoprotein  100 
 
 
166 aa  331  2e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413636  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01550  putative lipoprotein  96.99 
 
 
166 aa  323  9e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.814803  normal  0.550997 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1086  water stress/hypersensitive response protein  71.11 
 
 
157 aa  202  2e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.605963 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2944  hypothetical protein  62.77 
 
 
198 aa  186  2e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2572  putative lipoprotein  62.41 
 
 
176 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.737644 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2815  hypothetical protein  62.88 
 
 
180 aa  179  1e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3163  putative lipoprotein  62.88 
 
 
167 aa  179  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3621  putative lipoprotein  62.88 
 
 
167 aa  179  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.329911  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3634  putative lipoprotein  62.88 
 
 
167 aa  179  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3609  putative lipoprotein  62.88 
 
 
167 aa  179  1e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1729  putative lipoprotein  62.88 
 
 
167 aa  179  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0037  putative lipoprotein  62.88 
 
 
167 aa  179  1e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3546  water stress/hypersensitive response protein  56.16 
 
 
159 aa  177  8e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2191  putative lipoprotein  56.85 
 
 
159 aa  176  1e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1815  water stress/hypersensitive response domain-containing protein  54.79 
 
 
160 aa  175  2e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0854923  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3726  hypothetical protein  55.63 
 
 
196 aa  173  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3165  lipoprotein, putative  60.61 
 
 
159 aa  170  1e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.262178  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3032  putative lipoprotein  60.61 
 
 
159 aa  167  7e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0397077 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2902  water stress/hypersensitive response domain-containing protein  59.85 
 
 
180 aa  166  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.586012  normal  0.820452 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3428  water stress/hypersensitive response domain-containing protein  61.94 
 
 
162 aa  166  1e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.765772  normal  0.866468 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1928  Water Stress and Hypersensitive response domain protein  51.02 
 
 
167 aa  166  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.198508  normal  0.554929 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0426  water stress/hypersensitive response domain-containing protein  59.09 
 
 
164 aa  164  4e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.63413 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1033  water stress/hypersensitive response domain-containing protein  52.86 
 
 
163 aa  164  5e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.357786  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2272  putative lipoprotein  57.04 
 
 
167 aa  164  5.9999999999999996e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000762605  normal  0.468877 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2611  hypothetical protein  58.33 
 
 
164 aa  164  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.476035  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0399  hypothetical protein  56.62 
 
 
164 aa  164  5.9999999999999996e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0494  hypothetical protein  58.33 
 
 
164 aa  164  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.655749  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3583  hypothetical protein  60.32 
 
 
183 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.732027 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0467  water stress/hypersensitive response domain-containing protein  58.33 
 
 
164 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.353267 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2421  hypothetical protein  51.97 
 
 
158 aa  149  2e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0086  Water Stress and Hypersensitive response domain protein  55.97 
 
 
166 aa  146  1.0000000000000001e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3555  water stress/hypersensitive response domain-containing protein  50 
 
 
160 aa  130  6.999999999999999e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.113514 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0226  hypothetical protein  47.89 
 
 
157 aa  121  5e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.10133  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1587  Water Stress and Hypersensitive response domain protein  35.04 
 
 
158 aa  77.8  0.00000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.205042  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0609  hypothetical protein  35.94 
 
 
159 aa  73.9  0.0000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.647076  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1774  water stress/hypersensitive response protein  31.29 
 
 
161 aa  73.6  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.676059 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0650  hypothetical protein  32.65 
 
 
167 aa  69.7  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0799  Water Stress and Hypersensitive response domain protein  32.65 
 
 
167 aa  69.7  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.335821  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0942  putative lipoprotein  33.33 
 
 
160 aa  68.6  0.00000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.236049  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3789  putative lipoprotein  27.7 
 
 
167 aa  67.8  0.00000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1708  hypothetical protein  33.33 
 
 
193 aa  66.6  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1043  Water Stress and Hypersensitive response domain protein  28.78 
 
 
172 aa  61.6  0.000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.402135 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0149  putative lipoprotein  31.34 
 
 
160 aa  59.7  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.400959  normal  0.856742 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3440  Water Stress and Hypersensitive response domain protein  29.2 
 
 
155 aa  55.5  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.983784  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1417  water stress/hypersensitive response protein  28.57 
 
 
165 aa  53.9  0.0000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00876316  normal  0.917345 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1574  trigger factor  28.15 
 
 
153 aa  52.8  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000227775  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1217  hypothetical protein  25 
 
 
161 aa  51.6  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3319  Late embryogenesis abundant protein 2  30.77 
 
 
165 aa  45.4  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000162689  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2480  putative lipoprotein  25.81 
 
 
167 aa  45.4  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  2.30613e-17  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0927  Late embryogenesis abundant protein 2  30.77 
 
 
165 aa  45.4  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5672e-31 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0667  water stress/hypersensitive response domain-containing protein  24.05 
 
 
159 aa  44.3  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0079  water stress/hypersensitive response domain-containing protein  33.33 
 
 
276 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.801419  normal  0.160349 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2935  late embryogenesis abundant protein 2  26.52 
 
 
280 aa  42  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1154  water stress/hypersensitive response protein  22.95 
 
 
167 aa  41.2  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4130  hypothetical protein  22.7 
 
 
164 aa  40.4  0.01  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>