55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10247_3163 on replicon NC_009080
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA2815  hypothetical protein  100 
 
 
180 aa  330  7.000000000000001e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1729  putative lipoprotein  100 
 
 
167 aa  329  1e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3163  putative lipoprotein  100 
 
 
167 aa  329  1e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3634  putative lipoprotein  100 
 
 
167 aa  329  1e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0037  putative lipoprotein  100 
 
 
167 aa  329  1e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3621  putative lipoprotein  100 
 
 
167 aa  329  1e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.329911  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3609  putative lipoprotein  100 
 
 
167 aa  329  1e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2944  hypothetical protein  89.82 
 
 
198 aa  259  1e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1928  Water Stress and Hypersensitive response domain protein  67.61 
 
 
167 aa  198  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.198508  normal  0.554929 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1033  water stress/hypersensitive response domain-containing protein  66.2 
 
 
163 aa  198  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.357786  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3726  hypothetical protein  62.34 
 
 
196 aa  198  3e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3583  hypothetical protein  70.21 
 
 
183 aa  197  5e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.732027 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2611  hypothetical protein  70.21 
 
 
164 aa  197  5e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.476035  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0494  hypothetical protein  70.21 
 
 
164 aa  197  5e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.655749  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0467  water stress/hypersensitive response domain-containing protein  69.5 
 
 
164 aa  195  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.353267 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2902  water stress/hypersensitive response domain-containing protein  63.41 
 
 
180 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.586012  normal  0.820452 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0399  hypothetical protein  66.22 
 
 
164 aa  195  3e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0426  water stress/hypersensitive response domain-containing protein  67.38 
 
 
164 aa  191  4e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.63413 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2272  putative lipoprotein  68.31 
 
 
167 aa  188  2.9999999999999997e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000762605  normal  0.468877 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0203  putative lipoprotein  58.78 
 
 
166 aa  184  5e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413636  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01550  putative lipoprotein  57.52 
 
 
166 aa  180  7e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.814803  normal  0.550997 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2572  putative lipoprotein  60.15 
 
 
176 aa  177  4.999999999999999e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.737644 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1086  water stress/hypersensitive response protein  66.92 
 
 
157 aa  176  1e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.605963 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1815  water stress/hypersensitive response domain-containing protein  56.38 
 
 
160 aa  170  1e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0854923  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2191  putative lipoprotein  56.55 
 
 
159 aa  169  2e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3032  putative lipoprotein  61.31 
 
 
159 aa  167  8e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0397077 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3546  water stress/hypersensitive response protein  55.17 
 
 
159 aa  167  8e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3165  lipoprotein, putative  60.29 
 
 
159 aa  166  1e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.262178  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2421  hypothetical protein  60.99 
 
 
158 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3428  water stress/hypersensitive response domain-containing protein  60.61 
 
 
162 aa  157  5e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.765772  normal  0.866468 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0086  Water Stress and Hypersensitive response domain protein  59.4 
 
 
166 aa  153  8e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3555  water stress/hypersensitive response domain-containing protein  57.94 
 
 
160 aa  137  7e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.113514 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0226  hypothetical protein  52.11 
 
 
157 aa  131  3.9999999999999996e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.10133  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0609  hypothetical protein  36.57 
 
 
159 aa  78.2  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.647076  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1587  Water Stress and Hypersensitive response domain protein  33.08 
 
 
158 aa  70.1  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.205042  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1574  trigger factor  28.66 
 
 
153 aa  67.8  0.00000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000227775  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1774  water stress/hypersensitive response protein  27.89 
 
 
161 aa  67  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.676059 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3789  putative lipoprotein  28.48 
 
 
167 aa  61.6  0.000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0799  Water Stress and Hypersensitive response domain protein  32.05 
 
 
167 aa  60.5  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.335821  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1043  Water Stress and Hypersensitive response domain protein  32.2 
 
 
172 aa  60.1  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.402135 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0650  hypothetical protein  32.05 
 
 
167 aa  60.5  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50940  hypothetical protein  31.47 
 
 
164 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.30636  hitchhiker  0.0000172849 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1708  hypothetical protein  31.53 
 
 
193 aa  58.9  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0149  putative lipoprotein  30.65 
 
 
160 aa  58.2  0.00000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.400959  normal  0.856742 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1417  water stress/hypersensitive response protein  30.95 
 
 
165 aa  57  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00876316  normal  0.917345 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0942  putative lipoprotein  29.27 
 
 
160 aa  57  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.236049  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4345  hypothetical protein  30.71 
 
 
151 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1217  hypothetical protein  26.72 
 
 
161 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2935  late embryogenesis abundant protein 2  29.77 
 
 
280 aa  45.8  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3440  Water Stress and Hypersensitive response domain protein  27.21 
 
 
155 aa  46.6  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.983784  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19360  hypothetical protein  27.68 
 
 
136 aa  42.7  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.865107  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3319  Late embryogenesis abundant protein 2  31.37 
 
 
165 aa  42  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000162689  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0927  Late embryogenesis abundant protein 2  29.9 
 
 
165 aa  42  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5672e-31 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0667  water stress/hypersensitive response domain-containing protein  27.33 
 
 
159 aa  41.6  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0079  water stress/hypersensitive response domain-containing protein  36.11 
 
 
276 aa  40.8  0.009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.801419  normal  0.160349 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>