60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4345 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4345  hypothetical protein  100 
 
 
151 aa  311  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50940  hypothetical protein  95.36 
 
 
164 aa  303  6e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.30636  hitchhiker  0.0000172849 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1417  water stress/hypersensitive response protein  71.05 
 
 
165 aa  231  3e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00876316  normal  0.917345 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19360  hypothetical protein  68.66 
 
 
136 aa  192  1e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.865107  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25340  hypothetical protein  54.36 
 
 
167 aa  163  8e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4130  hypothetical protein  50.34 
 
 
164 aa  161  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1217  hypothetical protein  53.85 
 
 
161 aa  157  4e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1139  water stress/hypersensitive response domain-containing protein  52.11 
 
 
158 aa  155  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.398344  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4298  water stress/hypersensitive response domain-containing protein  51.41 
 
 
158 aa  154  4e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.541122  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1115  putative lipoprotein  48.23 
 
 
167 aa  151  4e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00366375 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1154  water stress/hypersensitive response protein  48.23 
 
 
167 aa  149  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3866  hypothetical protein  44.83 
 
 
163 aa  144  5e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.10342  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1587  Water Stress and Hypersensitive response domain protein  35.09 
 
 
158 aa  83.2  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.205042  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3789  putative lipoprotein  29.1 
 
 
167 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0942  putative lipoprotein  32.35 
 
 
160 aa  81.6  0.000000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.236049  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0609  hypothetical protein  35.07 
 
 
159 aa  80.9  0.000000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.647076  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1708  hypothetical protein  34.45 
 
 
193 aa  71.6  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0086  Late embryogenesis abundant protein 2  29.46 
 
 
277 aa  62.8  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0098  Late embryogenesis abundant protein 2  29.46 
 
 
277 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.817518  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0080  hypothetical protein  28.68 
 
 
295 aa  61.2  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.669106  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1574  trigger factor  31.68 
 
 
153 aa  60.8  0.000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000227775  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1033  water stress/hypersensitive response domain-containing protein  28.79 
 
 
163 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.357786  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2421  hypothetical protein  30.08 
 
 
158 aa  60.1  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3440  Water Stress and Hypersensitive response domain protein  27.69 
 
 
155 aa  60.1  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.983784  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3726  hypothetical protein  32.12 
 
 
196 aa  60.1  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3583  hypothetical protein  31.34 
 
 
183 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.732027 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1928  Water Stress and Hypersensitive response domain protein  30.08 
 
 
167 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.198508  normal  0.554929 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0399  hypothetical protein  27.08 
 
 
164 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0467  water stress/hypersensitive response domain-containing protein  30.83 
 
 
164 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.353267 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0494  hypothetical protein  30.08 
 
 
164 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.655749  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2611  hypothetical protein  30.08 
 
 
164 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.476035  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2815  hypothetical protein  30.37 
 
 
180 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3621  putative lipoprotein  30.37 
 
 
167 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.329911  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3163  putative lipoprotein  30.37 
 
 
167 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3634  putative lipoprotein  30.37 
 
 
167 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3609  putative lipoprotein  30.37 
 
 
167 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1729  putative lipoprotein  30.37 
 
 
167 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0037  putative lipoprotein  30.37 
 
 
167 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0426  water stress/hypersensitive response domain-containing protein  27.82 
 
 
164 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.63413 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2272  putative lipoprotein  29.37 
 
 
167 aa  53.5  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000762605  normal  0.468877 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2902  water stress/hypersensitive response domain-containing protein  29.55 
 
 
180 aa  52.4  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.586012  normal  0.820452 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2944  hypothetical protein  30.08 
 
 
198 aa  52.8  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0079  water stress/hypersensitive response domain-containing protein  29.25 
 
 
276 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.801419  normal  0.160349 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0619  hypothetical protein  30 
 
 
170 aa  51.6  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00260364  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1086  water stress/hypersensitive response protein  28.18 
 
 
157 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.605963 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0650  hypothetical protein  26.12 
 
 
167 aa  49.3  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1774  water stress/hypersensitive response protein  23.85 
 
 
161 aa  48.9  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.676059 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0799  Water Stress and Hypersensitive response domain protein  26.12 
 
 
167 aa  49.3  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.335821  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0149  putative lipoprotein  28.1 
 
 
160 aa  48.1  0.00005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.400959  normal  0.856742 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0927  Late embryogenesis abundant protein 2  24.67 
 
 
165 aa  47.4  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5672e-31 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3319  Late embryogenesis abundant protein 2  24.67 
 
 
165 aa  47.4  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000162689  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0384  hypothetical protein  28.3 
 
 
277 aa  47  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0413  Water Stress and Hypersensitive response domain protein  29.55 
 
 
280 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2572  putative lipoprotein  25.66 
 
 
176 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.737644 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2756  water stress/hypersensitive response protein  21.23 
 
 
264 aa  45.1  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.718779  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0226  hypothetical protein  24.31 
 
 
157 aa  44.7  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.10133  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1164  water stress/hypersensitive response protein  25.44 
 
 
168 aa  44.3  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0412  Water Stress and Hypersensitive response domain protein  29.55 
 
 
280 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3032  putative lipoprotein  27.52 
 
 
159 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0397077 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0086  Water Stress and Hypersensitive response domain protein  22 
 
 
166 aa  40.4  0.009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>