64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0149 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_0149  putative lipoprotein  100 
 
 		 160 aa  319  9.000000000000001e-87  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.400959  normal  0.856742 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0609  hypothetical protein  34.56 
 
 		 159 aa  80.9  0.000000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.647076  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1587  Water Stress and Hypersensitive response domain protein  33.33 
 
 		 158 aa  74.3  0.0000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.205042  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3546  water stress/hypersensitive response protein  32.85 
 
 		 159 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2191  putative lipoprotein  32.85 
 
 		 159 aa  68.2  0.00000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1815  water stress/hypersensitive response domain-containing protein  31.39 
 
 		 160 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0854923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3726  hypothetical protein  31.2 
 
 		 196 aa  61.6  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1928  Water Stress and Hypersensitive response domain protein  34.75 
 
 		 167 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.198508  normal  0.554929 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0203  putative lipoprotein  31.34 
 
 		 166 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413636  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0226  hypothetical protein  31.71 
 
 		 157 aa  59.3  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.10133  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2572  putative lipoprotein  33.91 
 
 		 176 aa  58.2  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.737644 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2421  hypothetical protein  31.94 
 
 		 158 aa  57.8  0.00000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1708  hypothetical protein  29.03 
 
 		 193 aa  57.4  0.00000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2935  late embryogenesis abundant protein 2  28.4 
 
 		 280 aa  55.8  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3621  putative lipoprotein  31.03 
 
 		 167 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.329911  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1086  water stress/hypersensitive response protein  34.48 
 
 		 157 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.605963 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3163  putative lipoprotein  31.03 
 
 		 167 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3634  putative lipoprotein  31.03 
 
 		 167 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3609  putative lipoprotein  31.03 
 
 		 167 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1729  putative lipoprotein  31.03 
 
 		 167 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0037  putative lipoprotein  31.03 
 
 		 167 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01550  putative lipoprotein  29.03 
 
 		 166 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.814803  normal  0.550997 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2815  hypothetical protein  31.03 
 
 		 180 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0799  Water Stress and Hypersensitive response domain protein  30.5 
 
 		 167 aa  55.1  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.335821  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0650  hypothetical protein  30.5 
 
 		 167 aa  55.1  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2944  hypothetical protein  31.58 
 
 		 198 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3428  water stress/hypersensitive response domain-containing protein  31.3 
 
 		 162 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.765772  normal  0.866468 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1043  Water Stress and Hypersensitive response domain protein  30.95 
 
 		 172 aa  54.7  0.0000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.402135 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2272  putative lipoprotein  33.33 
 
 		 167 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000762605  normal  0.468877 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3165  lipoprotein, putative  30.07 
 
 		 159 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.262178  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2480  putative lipoprotein  30.61 
 
 		 167 aa  53.9  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  2.30613e-17  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0399  hypothetical protein  31.71 
 
 		 164 aa  53.1  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3032  putative lipoprotein  31.3 
 
 		 159 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0397077 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3286  water stress/hypersensitive response protein  25.66 
 
 		 165 aa  51.6  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000209158  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0942  putative lipoprotein  26.32 
 
 		 160 aa  51.2  0.000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.236049  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1417  water stress/hypersensitive response protein  28.87 
 
 		 165 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00876316  normal  0.917345 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2902  water stress/hypersensitive response domain-containing protein  33.33 
 
 		 180 aa  50.4  0.000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.586012  normal  0.820452 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0086  Water Stress and Hypersensitive response domain protein  30.28 
 
 		 166 aa  49.7  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50940  hypothetical protein  28.1 
 
 		 164 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.30636  hitchhiker  0.0000172849 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1033  water stress/hypersensitive response domain-containing protein  30.77 
 
 		 163 aa  49.7  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.357786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0494  hypothetical protein  30.83 
 
 		 164 aa  48.9  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.655749  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2611  hypothetical protein  30.83 
 
 		 164 aa  48.9  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.476035  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3583  hypothetical protein  30.83 
 
 		 183 aa  48.9  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.732027 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2373  putative lipoprotein  28.39 
 
 		 167 aa  48.9  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.172517  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3789  putative lipoprotein  33.33 
 
 		 167 aa  48.5  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0467  water stress/hypersensitive response domain-containing protein  30.83 
 
 		 164 aa  48.5  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.353267 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4345  hypothetical protein  28.1 
 
 		 151 aa  48.1  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0426  water stress/hypersensitive response domain-containing protein  30.83 
 
 		 164 aa  47.8  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.63413 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3319  Late embryogenesis abundant protein 2  26.57 
 
 		 165 aa  47  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000162689  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1139  water stress/hypersensitive response domain-containing protein  31.39 
 
 		 158 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.398344  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0927  Late embryogenesis abundant protein 2  27.27 
 
 		 165 aa  45.1  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5672e-31 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2328  hypothetical protein  29.77 
 
 		 261 aa  44.7  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.619174 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1154  water stress/hypersensitive response protein  27.12 
 
 		 167 aa  44.3  0.0008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4298  water stress/hypersensitive response domain-containing protein  30.19 
 
 		 158 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.541122  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3440  Water Stress and Hypersensitive response domain protein  26.32 
 
 		 155 aa  43.9  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.983784  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1115  putative lipoprotein  27.12 
 
 		 167 aa  43.9  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00366375 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0619  hypothetical protein  26.57 
 
 		 170 aa  43.1  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00260364  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1217  hypothetical protein  25.2 
 
 		 161 aa  43.1  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4130  hypothetical protein  25.55 
 
 		 164 aa  43.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1164  water stress/hypersensitive response protein  24.6 
 
 		 168 aa  42.4  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25340  hypothetical protein  26.43 
 
 		 167 aa  42.4  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3866  hypothetical protein  25.97 
 
 		 163 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.10342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1774  water stress/hypersensitive response protein  25.58 
 
 		 161 aa  42  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.676059 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19360  hypothetical protein  26.36 
 
 		 136 aa  40.8  0.008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.865107  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>